More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1507 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  100 
 
 		 873 aa  1771    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  48.45 
 
 		 768 aa  255  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3336  Alginate lyase 2  39.27 
 
 		 258 aa  170  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  37.05 
 
 		 912 aa  142  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  56.3 
 
 		 818 aa  137  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  39.04 
 
 		 1565 aa  127  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  41.85 
 
 		 816 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  35.89 
 
 		 1150 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  42.68 
 
 		 674 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  40.72 
 
 		 792 aa  115  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  42.94 
 
 		 623 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  37.71 
 
 		 1916 aa  111  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  41.04 
 
 		 1057 aa  108  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  50.42 
 
 		 748 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.74 
 
 		 1246 aa  100  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3272  hypothetical protein  43.22 
 
 		 552 aa  100  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000109169  hitchhiker  0.00653931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  37.57 
 
 		 2066 aa  96.3  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  37.81 
 
 		 734 aa  93.2  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2478  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.84 
 
 		 524 aa  92  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  37.04 
 
 		 3197 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  37.79 
 
 		 1842 aa  80.9  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  37.04 
 
 		 3197 aa  80.9  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  36.2 
 
 		 918 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  29.53 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0130  protease, putative  38.89 
 
 		 935 aa  78.2  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0826  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.85 
 
 		 159 aa  78.2  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0155823  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  36.05 
 
 		 2036 aa  78.2  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  36.31 
 
 		 561 aa  78.2  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0610  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.85 
 
 		 159 aa  78.2  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  36.69 
 
 		 938 aa  77.8  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.63 
 
 		 773 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  34.88 
 
 		 1300 aa  77.4  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  39.31 
 
 		 752 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  35.1 
 
 		 552 aa  77.4  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  44.68 
 
 		 884 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  32.82 
 
 		 713 aa  77  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  29.71 
 
 		 1162 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  36.43 
 
 		 1094 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  37.7 
 
 		 575 aa  75.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  44.19 
 
 		 712 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  34.18 
 
 		 1620 aa  75.9  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  30.51 
 
 		 1011 aa  75.1  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  35.76 
 
 		 869 aa  74.7  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  34.46 
 
 		 735 aa  74.7  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  38.26 
 
 		 791 aa  74.7  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  35.84 
 
 		 1602 aa  74.3  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  42.98 
 
 		 677 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  43.93 
 
 		 943 aa  73.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  37.64 
 
 		 1236 aa  73.9  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  36.31 
 
 		 910 aa  73.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  35.21 
 
 		 685 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  36.05 
 
 		 1882 aa  73.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  35.34 
 
 		 936 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  35.34 
 
 		 936 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  36.23 
 
 		 1095 aa  72.8  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  36.3 
 
 		 400 aa  73.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  45.56 
 
 		 780 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.95 
 
 		 1606 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  35 
 
 		 679 aa  72  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  32.94 
 
 		 675 aa  72  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  35.71 
 
 		 669 aa  72.4  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  32.35 
 
 		 1361 aa  72  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  34.32 
 
 		 517 aa  71.6  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  35.71 
 
 		 940 aa  71.6  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  30.16 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  30.32 
 
 		 918 aa  71.2  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0047  peptidase M6, immune inhibitor A  33.1 
 
 		 945 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  29.44 
 
 		 2176 aa  70.9  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2547  translation initiation factor SUI1  38.6 
 
 		 611 aa  71.2  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.858491  hitchhiker  0.00146085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  33.52 
 
 		 713 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  34.36 
 
 		 658 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  30.98 
 
 		 1771 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  36.18 
 
 		 1969 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  27.43 
 
 		 850 aa  70.5  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  34.48 
 
 		 944 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  36.26 
 
 		 596 aa  69.7  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  35.09 
 
 		 2554 aa  70.1  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.91 
 
 		 947 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  36.36 
 
 		 814 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  33.93 
 
 		 1528 aa  70.1  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  31.47 
 
 		 1011 aa  70.1  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  33.73 
 
 		 1732 aa  70.1  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  37.31 
 
 		 2000 aa  69.3  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2147  PKD domain containing protein  27.85 
 
 		 1556 aa  69.3  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.927191  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  32.82 
 
 		 1104 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.29 
 
 		 940 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  33.7 
 
 		 560 aa  68.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  32.18 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  32.47 
 
 		 929 aa  68.9  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  32.82 
 
 		 1104 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  35.57 
 
 		 1120 aa  68.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  29.33 
 
 		 859 aa  68.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  38.12 
 
 		 2122 aa  68.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  36.17 
 
 		 938 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  32.63 
 
 		 1282 aa  68.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  35.03 
 
 		 1862 aa  67.8  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  31.4 
 
 		 967 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  33.9 
 
 		 769 aa  67  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.48 
 
 		 945 aa  67  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  34.87 
 
 		 978 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>