More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1473 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  60.14 
 
 		 713 aa  767    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  79.1 
 
 		 685 aa  1061    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  62.48 
 
 		 658 aa  751    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  100 
 
 		 679 aa  1380    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  63.22 
 
 		 675 aa  780    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  64.19 
 
 		 669 aa  790    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  52.7 
 
 		 581 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  71.92 
 
 		 735 aa  480  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  71.64 
 
 		 1094 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  68.99 
 
 		 752 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  51.23 
 
 		 560 aa  459  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  67.05 
 
 		 1682 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  65.8 
 
 		 2272 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  67.83 
 
 		 859 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  67.17 
 
 		 561 aa  424  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  63.25 
 
 		 1882 aa  419  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  64.46 
 
 		 1300 aa  415  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  63.55 
 
 		 2036 aa  413  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  61.45 
 
 		 1842 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  62.87 
 
 		 1120 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  63.17 
 
 		 1969 aa  395  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  59.83 
 
 		 2122 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  61.38 
 
 		 2000 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  55.42 
 
 		 978 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  62.09 
 
 		 575 aa  391  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  59.83 
 
 		 1241 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  78.63 
 
 		 551 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  75.92 
 
 		 791 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  74.6 
 
 		 547 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  39.69 
 
 		 971 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  55.65 
 
 		 1667 aa  362  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  52.02 
 
 		 615 aa  346  7e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  52.38 
 
 		 1361 aa  341  2.9999999999999998e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  52.37 
 
 		 528 aa  334  3e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  52.71 
 
 		 1356 aa  330  7e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  52.46 
 
 		 963 aa  326  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  53.25 
 
 		 930 aa  320  7.999999999999999e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  48.5 
 
 		 1862 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  46.9 
 
 		 1282 aa  312  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  49.28 
 
 		 2554 aa  299  9e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  46.49 
 
 		 530 aa  296  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  49.24 
 
 		 838 aa  290  9e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  36.18 
 
 		 938 aa  288  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  51.83 
 
 		 3295 aa  280  7e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  45.11 
 
 		 941 aa  278  2e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  48.64 
 
 		 460 aa  278  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.65 
 
 		 958 aa  270  8e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  47.91 
 
 		 910 aa  269  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  54.51 
 
 		 1732 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  73.6 
 
 		 184 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  52.99 
 
 		 1236 aa  257  6e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  41.76 
 
 		 1528 aa  256  8e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  45.83 
 
 		 861 aa  256  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  41.93 
 
 		 869 aa  253  8.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  46.39 
 
 		 1667 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  44.57 
 
 		 1387 aa  238  3e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  43.02 
 
 		 1783 aa  234  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  71.6 
 
 		 644 aa  233  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.88 
 
 		 823 aa  230  7e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  41.84 
 
 		 1292 aa  228  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  37.06 
 
 		 1001 aa  224  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  41.35 
 
 		 719 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  39.94 
 
 		 840 aa  221  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.3 
 
 		 870 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  47.06 
 
 		 930 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.23 
 
 		 802 aa  210  6e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  42.98 
 
 		 443 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  30.67 
 
 		 769 aa  204  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  47.62 
 
 		 2552 aa  204  5e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.64 
 
 		 845 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  40.53 
 
 		 929 aa  198  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  36.69 
 
 		 952 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  32.55 
 
 		 819 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  41.98 
 
 		 786 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  39.13 
 
 		 1011 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  31.84 
 
 		 771 aa  187  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.15 
 
 		 819 aa  186  9e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  43.15 
 
 		 777 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  37.61 
 
 		 2176 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  46.64 
 
 		 1095 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  36.71 
 
 		 1531 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  52.57 
 
 		 519 aa  178  3e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  35.69 
 
 		 439 aa  177  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  35.67 
 
 		 1814 aa  176  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  41.36 
 
 		 821 aa  174  3.9999999999999995e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  42.5 
 
 		 1189 aa  174  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  39.02 
 
 		 374 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  36.39 
 
 		 728 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  40 
 
 		 379 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  34.65 
 
 		 1380 aa  170  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  34.92 
 
 		 865 aa  169  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  54.12 
 
 		 1231 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  47.59 
 
 		 500 aa  160  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  43.88 
 
 		 1931 aa  160  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  43.72 
 
 		 408 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  44.35 
 
 		 1620 aa  157  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  47.03 
 
 		 1328 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  49.09 
 
 		 816 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  40.78 
 
 		 848 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  40.68 
 
 		 1602 aa  150  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>