More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1796 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  100 
 
 		 848 aa  1710    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  47.03 
 
 		 2554 aa  602  1e-170  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  42.1 
 
 		 3295 aa  526  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  47.75 
 
 		 1732 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  47.15 
 
 		 787 aa  342  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  49.54 
 
 		 361 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  60.17 
 
 		 682 aa  294  5e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  47.87 
 
 		 653 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  57.01 
 
 		 670 aa  265  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  54.81 
 
 		 344 aa  264  6e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  51.46 
 
 		 349 aa  249  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  45.2 
 
 		 320 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  49.29 
 
 		 1380 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  45.91 
 
 		 276 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  43.22 
 
 		 777 aa  172  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  45.54 
 
 		 2122 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  40.45 
 
 		 1120 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  40.78 
 
 		 2036 aa  165  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  42.41 
 
 		 719 aa  164  8.000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.62 
 
 		 819 aa  163  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  39.5 
 
 		 1361 aa  163  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  41.22 
 
 		 581 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  40.51 
 
 		 713 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  39.16 
 
 		 859 aa  161  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  40.8 
 
 		 752 aa  161  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  43 
 
 		 184 aa  161  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  41.22 
 
 		 2272 aa  160  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  39.18 
 
 		 1969 aa  160  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  44.58 
 
 		 870 aa  160  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  40.4 
 
 		 1300 aa  160  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  43.57 
 
 		 823 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  40.73 
 
 		 675 aa  160  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  42.04 
 
 		 978 aa  160  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  41.83 
 
 		 669 aa  159  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  42.08 
 
 		 1236 aa  158  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40.65 
 
 		 1241 aa  158  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  44.77 
 
 		 1356 aa  158  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  43.04 
 
 		 528 aa  158  5.0000000000000005e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  39.11 
 
 		 1882 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.36 
 
 		 786 aa  157  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  41.63 
 
 		 679 aa  157  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.8 
 
 		 1842 aa  157  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  42.79 
 
 		 547 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  41.37 
 
 		 1682 aa  156  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  40.08 
 
 		 791 aa  156  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  42.62 
 
 		 845 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  39 
 
 		 1094 aa  154  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  39.84 
 
 		 575 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  41.11 
 
 		 1667 aa  154  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  42.72 
 
 		 685 aa  154  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  40.57 
 
 		 551 aa  153  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  42.5 
 
 		 460 aa  152  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  39.37 
 
 		 735 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  39.74 
 
 		 615 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  41.22 
 
 		 2000 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  38.06 
 
 		 561 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  43.44 
 
 		 910 aa  153  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  40.98 
 
 		 840 aa  152  3e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  42.48 
 
 		 530 aa  150  8e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1811  hypothetical protein  40 
 
 		 272 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  42.04 
 
 		 802 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  41.2 
 
 		 963 aa  147  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  37.95 
 
 		 658 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  40.1 
 
 		 1282 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  37.85 
 
 		 1862 aa  139  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  42.65 
 
 		 519 aa  137  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  36.99 
 
 		 958 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  40.34 
 
 		 941 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  35.47 
 
 		 1528 aa  135  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  40.59 
 
 		 838 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  38.13 
 
 		 930 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  38.16 
 
 		 644 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  39.09 
 
 		 861 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  42.38 
 
 		 1667 aa  127  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  35.59 
 
 		 560 aa  127  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  40.36 
 
 		 930 aa  126  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  38.05 
 
 		 439 aa  125  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  38.57 
 
 		 1328 aa  125  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  37.33 
 
 		 400 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  36.87 
 
 		 816 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  37.44 
 
 		 1931 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  35.52 
 
 		 869 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  35.58 
 
 		 500 aa  119  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  37.45 
 
 		 1387 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  32.21 
 
 		 1231 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  72.86 
 
 		 749 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  43.66 
 
 		 581 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  70.59 
 
 		 676 aa  115  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  39.07 
 
 		 1531 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  36.71 
 
 		 2552 aa  114  6e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  64.47 
 
 		 387 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  38.53 
 
 		 996 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  71.43 
 
 		 579 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  39.29 
 
 		 940 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  34.09 
 
 		 971 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  64.1 
 
 		 668 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  55.21 
 
 		 488 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  31.09 
 
 		 938 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  34.52 
 
 		 1189 aa  109  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  56.96 
 
 		 403 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>