19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1798 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  74.07 
 
 
653 aa  676    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  100 
 
 
682 aa  1332    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  73 
 
 
670 aa  618  1e-175  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  62.78 
 
 
848 aa  287  4e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  50 
 
 
787 aa  256  8e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  51.53 
 
 
344 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  45.85 
 
 
349 aa  240  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  47.77 
 
 
3295 aa  219  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  41.7 
 
 
320 aa  207  5e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  46.85 
 
 
2554 aa  206  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  44.59 
 
 
1732 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  43.63 
 
 
361 aa  201  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  39.27 
 
 
276 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1811  hypothetical protein  38.97 
 
 
272 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0738  hypothetical protein  48.48 
 
 
627 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.140724  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0251  hypothetical protein  30.7 
 
 
298 aa  98.2  5e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.16959  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1803  hypothetical protein  31.03 
 
 
248 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  37.08 
 
 
1394 aa  51.6  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0257  hypothetical protein  33.33 
 
 
266 aa  49.3  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.583611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>