17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1815 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  100 
 
 
349 aa  717    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  81.07 
 
 
344 aa  544  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  48.84 
 
 
848 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  46.32 
 
 
682 aa  247  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  47.19 
 
 
320 aa  241  9e-63  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  45.76 
 
 
670 aa  238  8e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  42.8 
 
 
653 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  43.84 
 
 
787 aa  226  6e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  47.88 
 
 
3295 aa  219  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  41.2 
 
 
1732 aa  200  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  43.2 
 
 
2554 aa  200  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  41.43 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  41.28 
 
 
276 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1811  hypothetical protein  39.57 
 
 
272 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0251  hypothetical protein  34.68 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.16959  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1803  hypothetical protein  44.29 
 
 
248 aa  53.5  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0257  hypothetical protein  40.3 
 
 
266 aa  43.9  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.583611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>