15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1803 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1803  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  510  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0257  hypothetical protein  33.03 
 
 
266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  50.7 
 
 
344 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  33.16 
 
 
3295 aa  63.2  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  46.03 
 
 
2554 aa  62  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  46.03 
 
 
1732 aa  62  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  48.39 
 
 
361 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  41.46 
 
 
787 aa  58.9  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  32.17 
 
 
653 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  31.03 
 
 
682 aa  56.2  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  42.68 
 
 
848 aa  55.1  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  44.29 
 
 
349 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  39.44 
 
 
320 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  26.72 
 
 
670 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  35.37 
 
 
276 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>