17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1809 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  100 
 
 
344 aa  707    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  81.07 
 
 
349 aa  550  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  51.94 
 
 
848 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  50 
 
 
682 aa  263  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  49.81 
 
 
320 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  49.26 
 
 
670 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  46.13 
 
 
653 aa  241  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  41.38 
 
 
787 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  45.42 
 
 
3295 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  40.2 
 
 
1732 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  44.58 
 
 
2554 aa  200  3e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  42.91 
 
 
276 aa  199  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  41.83 
 
 
361 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1811  hypothetical protein  43.8 
 
 
272 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0251  hypothetical protein  31.12 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.16959  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1803  hypothetical protein  50.7 
 
 
248 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0257  hypothetical protein  39.71 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.583611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>