15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0251 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0251  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  606  9.999999999999999e-173  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.16959  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  34.91 
 
 
787 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  30.45 
 
 
3295 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  27.57 
 
 
848 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  28.52 
 
 
2554 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  28.26 
 
 
1732 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  30.48 
 
 
682 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  35.35 
 
 
361 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  33.8 
 
 
349 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  31.12 
 
 
344 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  28.64 
 
 
653 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  28.1 
 
 
670 aa  95.9  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  29.23 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1811  hypothetical protein  27.99 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  27.73 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>