271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1812 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  100 
 
 		 787 aa  1585    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  49.78 
 
 		 2554 aa  555  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 3295 aa  429  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  54.15 
 
 		 1732 aa  392  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  47.7 
 
 		 848 aa  372  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  52.55 
 
 		 361 aa  313  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  53.25 
 
 		 682 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  47.97 
 
 		 653 aa  239  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  51.09 
 
 		 670 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  44.93 
 
 		 344 aa  234  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  43.84 
 
 		 349 aa  226  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  42.63 
 
 		 320 aa  182  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  37.8 
 
 		 276 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1811  hypothetical protein  39.08 
 
 		 272 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.237705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0251  hypothetical protein  36.28 
 
 		 298 aa  124  8e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.16959  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  52.99 
 
 		 777 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  76.32 
 
 		 1356 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  66.67 
 
 		 579 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  62.22 
 
 		 581 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  62.35 
 
 		 930 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  66.67 
 
 		 958 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  69.44 
 
 		 869 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  69.62 
 
 		 823 aa  114  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  72.86 
 
 		 749 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  60.82 
 
 		 819 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  70.59 
 
 		 676 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  72.06 
 
 		 522 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  64.56 
 
 		 387 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  61.8 
 
 		 870 aa  111  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  60.76 
 
 		 403 aa  111  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  68.57 
 
 		 488 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  50.94 
 
 		 390 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  62.03 
 
 		 668 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  42.34 
 
 		 298 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  65.28 
 
 		 294 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  52.29 
 
 		 786 aa  107  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  67.14 
 
 		 709 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  67.14 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  61.36 
 
 		 627 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  54.76 
 
 		 522 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  61.84 
 
 		 919 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  43.24 
 
 		 1380 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  63.29 
 
 		 479 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  62.5 
 
 		 719 aa  104  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  69.84 
 
 		 561 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  57.83 
 
 		 831 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  35.59 
 
 		 389 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  64 
 
 		 735 aa  101  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  39.62 
 
 		 739 aa  100  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  57.89 
 
 		 391 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  60.76 
 
 		 802 aa  99.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  60.53 
 
 		 1056 aa  98.2  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  58.02 
 
 		 840 aa  97.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  56.79 
 
 		 845 aa  97.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.94 
 
 		 547 aa  96.3  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.26 
 
 		 343 aa  95.5  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  63.01 
 
 		 697 aa  95.1  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  54.79 
 
 		 479 aa  94.4  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  52.94 
 
 		 1236 aa  93.6  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  53.16 
 
 		 433 aa  93.2  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  51.14 
 
 		 110 aa  92  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  58.9 
 
 		 698 aa  90.9  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  52.56 
 
 		 184 aa  88.6  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  55.95 
 
 		 460 aa  87.4  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  46.88 
 
 		 581 aa  87  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  48.86 
 
 		 2272 aa  87  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  50 
 
 		 1120 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  46.88 
 
 		 2000 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  46.79 
 
 		 1361 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  47.25 
 
 		 547 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  45.83 
 
 		 2122 aa  85.5  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  43.4 
 
 		 978 aa  85.1  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  51.28 
 
 		 551 aa  84.7  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  42.45 
 
 		 1682 aa  84.7  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  43.12 
 
 		 2036 aa  84.7  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  44.79 
 
 		 575 aa  84.7  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  52.5 
 
 		 669 aa  84.3  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  45.65 
 
 		 1241 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  44.9 
 
 		 675 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  45.83 
 
 		 1969 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  53.66 
 
 		 910 aa  82.4  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  44.44 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  51.28 
 
 		 1842 aa  82  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  49.37 
 
 		 1882 aa  81.3  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  49.38 
 
 		 941 aa  81.3  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  51.28 
 
 		 1300 aa  80.9  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  44.79 
 
 		 685 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  43.48 
 
 		 713 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  44.79 
 
 		 560 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  50.62 
 
 		 679 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  54.67 
 
 		 1667 aa  79  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  51.69 
 
 		 930 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.62 
 
 		 1862 aa  78.2  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  47.06 
 
 		 615 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  37.61 
 
 		 859 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  40.95 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  41.67 
 
 		 791 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  46.84 
 
 		 561 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  43.22 
 
 		 528 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  42.86 
 
 		 940 aa  75.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>