162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0859 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  100 
 
 		 488 aa  981    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  63.99 
 
 		 479 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  52.47 
 
 		 910 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  56.52 
 
 		 930 aa  136  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  52.89 
 
 		 958 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  53.33 
 
 		 869 aa  127  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  62.65 
 
 		 676 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  67.53 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  66.27 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  66.67 
 
 		 668 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  76.12 
 
 		 522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  67.12 
 
 		 749 aa  117  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  67.12 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  49.11 
 
 		 1056 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  41.46 
 
 		 468 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  55.21 
 
 		 848 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  68.57 
 
 		 787 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  63.01 
 
 		 522 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  58.75 
 
 		 831 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  67.57 
 
 		 627 aa  109  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  64.86 
 
 		 735 aa  106  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  65.75 
 
 		 709 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  62.86 
 
 		 110 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  68.25 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  58.82 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  65.71 
 
 		 294 aa  99.8  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  55.95 
 
 		 919 aa  99.8  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  45.45 
 
 		 343 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  60.76 
 
 		 298 aa  98.2  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  55 
 
 		 739 aa  97.8  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  48.89 
 
 		 390 aa  97.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  53.33 
 
 		 697 aa  96.7  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  64.29 
 
 		 391 aa  96.7  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  47.06 
 
 		 389 aa  96.3  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  44.55 
 
 		 403 aa  95.9  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  56.94 
 
 		 698 aa  95.5  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  60.32 
 
 		 547 aa  90.9  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  52.7 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  51.47 
 
 		 595 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  53.97 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3328  Ig domain-containing protein  31.28 
 
 		 878 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.77 
 
 		 594 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  27.56 
 
 		 586 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  42.42 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  51.56 
 
 		 884 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  48.68 
 
 		 883 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  53.52 
 
 		 567 aa  67  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  44.44 
 
 		 887 aa  66.6  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  29.06 
 
 		 528 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  24.31 
 
 		 1744 aa  62.8  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  44.62 
 
 		 679 aa  60.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3494  hypothetical protein  26.14 
 
 		 681 aa  60.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.459183  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  42.17 
 
 		 1531 aa  60.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  60.47 
 
 		 669 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  46.67 
 
 		 675 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  24.74 
 
 		 450 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  40.58 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  64.1 
 
 		 1667 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  72.97 
 
 		 930 aa  58.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03670  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1032 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1898  glycosyl hydrolase  26.7 
 
 		 1083 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000419875  unclonable  0.0000213557 
 
 
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  63.41 
 
 		 2272 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  48.57 
 
 		 1282 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  63.04 
 
 		 963 aa  57.4  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  22.74 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  59.52 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  46.97 
 
 		 735 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  45 
 
 		 658 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  48.28 
 
 		 1120 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  45 
 
 		 713 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  25.72 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  56.25 
 
 		 560 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  47.92 
 
 		 685 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  45 
 
 		 581 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  60.87 
 
 		 1969 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  49.21 
 
 		 1882 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  46.67 
 
 		 547 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  41.18 
 
 		 791 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  55.56 
 
 		 752 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  60.98 
 
 		 978 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  60.98 
 
 		 575 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  19.87 
 
 		 366 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  59.57 
 
 		 1732 aa  55.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  58.54 
 
 		 2036 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  54.1 
 
 		 2000 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  60.98 
 
 		 1300 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  43.75 
 
 		 551 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  25.18 
 
 		 484 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  58.54 
 
 		 1241 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  23.53 
 
 		 909 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  55.77 
 
 		 3295 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  58.54 
 
 		 1682 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  61.9 
 
 		 460 aa  53.9  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  23.53 
 
 		 947 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  23.7 
 
 		 642 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  43.28 
 
 		 184 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  58.54 
 
 		 1842 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  61.54 
 
 		 374 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3934  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1117 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>