94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1008 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  84.47 
 
 		 697 aa  1184    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 698 aa  1435    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  46.45 
 
 		 561 aa  316  8e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  40.97 
 
 		 930 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  32.29 
 
 		 581 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.2 
 
 		 1085 aa  241  4e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30 
 
 		 709 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  35.88 
 
 		 1035 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  35.12 
 
 		 749 aa  147  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  31.06 
 
 		 433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  34.17 
 
 		 838 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  31.19 
 
 		 810 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  30.33 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  32.81 
 
 		 1931 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  35.83 
 
 		 468 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  28.27 
 
 		 724 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  27.76 
 
 		 777 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  63.51 
 
 		 479 aa  97.8  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  58.67 
 
 		 403 aa  96.7  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  61.97 
 
 		 361 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  27.5 
 
 		 1056 aa  95.1  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  56.94 
 
 		 488 aa  95.1  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  46.94 
 
 		 668 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  65.08 
 
 		 958 aa  93.6  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  30.04 
 
 		 735 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  27.3 
 
 		 620 aa  92.8  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  31.58 
 
 		 1092 aa  90.9  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  58.9 
 
 		 787 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  53.57 
 
 		 294 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  54.17 
 
 		 522 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  55.71 
 
 		 676 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  44.12 
 
 		 869 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  56.16 
 
 		 848 aa  88.2  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.89 
 
 		 547 aa  88.2  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  51.95 
 
 		 298 aa  87  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  33.49 
 
 		 1001 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  50 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  51.43 
 
 		 739 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  47.67 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  54.17 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  36.25 
 
 		 638 aa  84.7  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  50.62 
 
 		 387 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  49.43 
 
 		 735 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  26.55 
 
 		 635 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  29.04 
 
 		 595 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  52.11 
 
 		 831 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  51.39 
 
 		 930 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  57.81 
 
 		 522 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  34.15 
 
 		 564 aa  82  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  50.7 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  29.88 
 
 		 720 aa  81.6  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  50 
 
 		 110 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  48.72 
 
 		 919 aa  81.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  51.43 
 
 		 627 aa  78.6  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  30 
 
 		 810 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  31.46 
 
 		 940 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  32.95 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  42.86 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  44.87 
 
 		 960 aa  75.5  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  54.1 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  51.39 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  32.77 
 
 		 641 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  29.21 
 
 		 375 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  56.6 
 
 		 343 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  34.01 
 
 		 871 aa  68.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  41.56 
 
 		 528 aa  68.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  28.48 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  27.5 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  30.73 
 
 		 582 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.58 
 
 		 614 aa  65.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 1121 aa  64.7  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  31.88 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  41.76 
 
 		 883 aa  63.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  32.58 
 
 		 954 aa  60.8  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.19 
 
 		 594 aa  60.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  45.31 
 
 		 884 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  42.86 
 
 		 887 aa  58.5  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0577  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.49 
 
 		 262 aa  57  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  23.45 
 
 		 831 aa  57  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  37.7 
 
 		 472 aa  56.2  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  28.1 
 
 		 805 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  30.28 
 
 		 424 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4005  peptidase C1A, papain  25.1 
 
 		 619 aa  47.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  36.47 
 
 		 1531 aa  47  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0487  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.51 
 
 		 254 aa  46.6  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  26.81 
 
 		 899 aa  46.2  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3733  parallel beta-helix repeat-containing protein  30 
 
 		 379 aa  45.8  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00966756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.14 
 
 		 746 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  31.51 
 
 		 975 aa  45.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0803  hypothetical protein  33.33 
 
 		 427 aa  44.7  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  23.62 
 
 		 1096 aa  43.9  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  27.38 
 
 		 271 aa  43.9  0.009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  27.38 
 
 		 271 aa  43.9  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>