14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3733 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3733  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 379 aa  763    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00966756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.57 
 
 		 614 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.29 
 
 		 230 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0487  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.43 
 
 		 254 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0577  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.19 
 
 		 262 aa  49.7  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1421  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.07 
 
 		 255 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.670143  normal  0.74275 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  31.06 
 
 		 697 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  31.02 
 
 		 1931 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0803  hypothetical protein  31.87 
 
 		 427 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1027  hypothetical protein  29.73 
 
 		 529 aa  46.6  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.13571  hitchhiker  0.00932998 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  26.36 
 
 		 831 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  30.84 
 
 		 698 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3832  parallel beta-helix repeat protein  37.35 
 
 		 870 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  27.33 
 
 		 595 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>