129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2930 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  100 
 
 		 641 aa  1245    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  32.57 
 
 		 638 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  41.63 
 
 		 471 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  37.11 
 
 		 940 aa  162  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  46.12 
 
 		 735 aa  150  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  32.23 
 
 		 871 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  37.37 
 
 		 352 aa  145  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  48.5 
 
 		 505 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  35.12 
 
 		 831 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  33.43 
 
 		 564 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  34.32 
 
 		 595 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  39.81 
 
 		 245 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  28.44 
 
 		 1200 aa  127  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  34.77 
 
 		 570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  34.27 
 
 		 409 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  29.36 
 
 		 1931 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  36.29 
 
 		 810 aa  111  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 1121 aa  110  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  32.66 
 
 		 635 aa  107  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  32.38 
 
 		 960 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1001 aa  105  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  37.17 
 
 		 777 aa  103  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  30.23 
 
 		 892 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  30.48 
 
 		 805 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  36.08 
 
 		 341 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  35.84 
 
 		 302 aa  97.4  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  30.53 
 
 		 820 aa  97.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  40.23 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  66.67 
 
 		 297 aa  95.5  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  38.89 
 
 		 1035 aa  94.4  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  36.04 
 
 		 1092 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.27 
 
 		 458 aa  91.3  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  38.3 
 
 		 375 aa  90.9  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  36.2 
 
 		 838 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  40.52 
 
 		 954 aa  88.6  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  33.81 
 
 		 810 aa  87.4  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  34.86 
 
 		 360 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  45.45 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  32.63 
 
 		 1628 aa  83.2  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  24.95 
 
 		 647 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.05 
 
 		 677 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  49.38 
 
 		 919 aa  80.5  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  30.13 
 
 		 1056 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  49.45 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  36.05 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  27.42 
 
 		 416 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  33.47 
 
 		 500 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.42 
 
 		 416 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.42 
 
 		 416 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  27.42 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  27.09 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  34.76 
 
 		 749 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  27.22 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  33.53 
 
 		 709 aa  73.9  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  29.69 
 
 		 1025 aa  73.6  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  27.85 
 
 		 1242 aa  72.4  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  32.77 
 
 		 698 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  32.77 
 
 		 697 aa  72.4  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  28.96 
 
 		 724 aa  71.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  25.8 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  29.79 
 
 		 648 aa  71.6  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  27.42 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  27.09 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.36 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  28.75 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  33.76 
 
 		 294 aa  68.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  26.42 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  26.42 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  36.17 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.1 
 
 		 467 aa  68.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  28 
 
 		 422 aa  66.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  27.2 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  24.34 
 
 		 720 aa  65.1  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  24.68 
 
 		 442 aa  65.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25.62 
 
 		 1332 aa  64.3  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  27 
 
 		 804 aa  64.3  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  34.15 
 
 		 620 aa  63.9  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  29.89 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  26.83 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  24.32 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  26.29 
 
 		 423 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  26.29 
 
 		 423 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  25.4 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  22.55 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  23.32 
 
 		 457 aa  57.4  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.38 
 
 		 685 aa  56.6  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  24.75 
 
 		 443 aa  57  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  31.3 
 
 		 365 aa  55.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  24.48 
 
 		 428 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  24.71 
 
 		 505 aa  55.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  32.65 
 
 		 582 aa  54.7  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  32.59 
 
 		 2036 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  31.85 
 
 		 1969 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  25.11 
 
 		 439 aa  53.9  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.08 
 
 		 425 aa  53.5  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  26.67 
 
 		 405 aa  53.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  28.98 
 
 		 382 aa  52  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24 
 
 		 467 aa  52  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30.45 
 
 		 2272 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  22.58 
 
 		 439 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>