265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2929 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  100 
 
 		 471 aa  942    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  45.33 
 
 		 735 aa  330  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  46.47 
 
 		 505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  35.59 
 
 		 1001 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  37.23 
 
 		 810 aa  227  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  42.73 
 
 		 940 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  32.98 
 
 		 960 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  39.44 
 
 		 635 aa  206  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  41.63 
 
 		 641 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  35.68 
 
 		 871 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.72 
 
 		 547 aa  153  8e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  29.72 
 
 		 564 aa  147  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  34.94 
 
 		 777 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  31.9 
 
 		 1056 aa  133  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  33.66 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  30.14 
 
 		 1931 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  31.27 
 
 		 1092 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  32.01 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  38.27 
 
 		 838 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  34.88 
 
 		 638 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  34.7 
 
 		 595 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  28.63 
 
 		 1300 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  38.3 
 
 		 245 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  29.08 
 
 		 831 aa  107  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  30.37 
 
 		 1969 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  30.72 
 
 		 409 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  33.23 
 
 		 297 aa  100  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  34.54 
 
 		 375 aa  98.2  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.16 
 
 		 458 aa  98.2  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  32.23 
 
 		 570 aa  97.1  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  49.11 
 
 		 938 aa  96.7  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  40.14 
 
 		 153 aa  95.5  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  30.23 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  34.25 
 
 		 1035 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  40.79 
 
 		 1682 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30.56 
 
 		 2272 aa  94  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  45.3 
 
 		 1096 aa  94  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  49.45 
 
 		 1120 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  56.82 
 
 		 819 aa  90.5  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  55.56 
 
 		 771 aa  90.1  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  30.59 
 
 		 805 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  31.52 
 
 		 892 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  30 
 
 		 724 aa  88.2  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  37.14 
 
 		 954 aa  88.2  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  51.65 
 
 		 861 aa  87.4  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 1121 aa  87.4  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  48.82 
 
 		 3295 aa  86.7  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  53.09 
 
 		 2122 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  27.69 
 
 		 820 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  37.06 
 
 		 525 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  34.93 
 
 		 360 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  48.42 
 
 		 2000 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  48.94 
 
 		 1328 aa  84  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  50.59 
 
 		 1241 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  47.96 
 
 		 575 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.06 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  53.09 
 
 		 2036 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  54.32 
 
 		 1882 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  34.45 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  25 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  25.76 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  25 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  40.87 
 
 		 1667 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  57.5 
 
 		 978 aa  80.1  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  53.09 
 
 		 1842 aa  80.1  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  24.44 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  50 
 
 		 275 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  28 
 
 		 919 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  31.93 
 
 		 1200 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  49.37 
 
 		 1311 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  50.62 
 
 		 725 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  56.16 
 
 		 1830 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  51.69 
 
 		 1356 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  32.95 
 
 		 698 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  48.35 
 
 		 561 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  53.66 
 
 		 1862 aa  74.7  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  24.47 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  22.72 
 
 		 417 aa  73.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  27.1 
 
 		 648 aa  73.6  0.000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  23.56 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  51.16 
 
 		 1732 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  36.75 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  24.53 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.52 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  23.2 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  34.78 
 
 		 433 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.52 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  28.29 
 
 		 501 aa  71.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  52.33 
 
 		 2554 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  23.33 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.72 
 
 		 467 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  23.33 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  57.81 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  24.25 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  25.75 
 
 		 437 aa  69.7  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  55.38 
 
 		 840 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  45.05 
 
 		 1361 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  53.85 
 
 		 719 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  50.75 
 
 		 2065 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  25.45 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>