175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1273 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  100 
 
 		 275 aa  549  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  48.45 
 
 		 960 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  41.4 
 
 		 2122 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  40 
 
 		 2272 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  47.02 
 
 		 1682 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1001 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  43.48 
 
 		 2000 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  46.91 
 
 		 978 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  37.91 
 
 		 1300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  45.68 
 
 		 575 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  39.38 
 
 		 1882 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  45.68 
 
 		 3295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  46.3 
 
 		 1732 aa  117  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  45.83 
 
 		 910 aa  116  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  42.79 
 
 		 2552 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  48.43 
 
 		 940 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  41.3 
 
 		 1328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  45.34 
 
 		 2554 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  45.96 
 
 		 1356 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  42.41 
 
 		 1862 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  43.9 
 
 		 1969 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  40.11 
 
 		 771 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  40.82 
 
 		 1236 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  41.9 
 
 		 1361 aa  109  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  39.57 
 
 		 861 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  41.25 
 
 		 1120 aa  109  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.46 
 
 		 1842 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  42.94 
 
 		 2036 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40.88 
 
 		 1241 aa  102  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.41 
 
 		 845 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  36.71 
 
 		 525 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  43.64 
 
 		 528 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  42.46 
 
 		 819 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  41.76 
 
 		 870 aa  99.4  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  40 
 
 		 941 aa  99  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  36.51 
 
 		 938 aa  99  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.18 
 
 		 823 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.83 
 
 		 786 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  40.99 
 
 		 615 aa  95.9  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  37.22 
 
 		 963 aa  95.9  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  40.12 
 
 		 530 aa  95.5  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  38.18 
 
 		 725 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  40.12 
 
 		 460 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  39.41 
 
 		 840 aa  95.1  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  38.55 
 
 		 1282 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  38.32 
 
 		 859 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  40.12 
 
 		 547 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  38.24 
 
 		 719 aa  92.4  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  39.29 
 
 		 669 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  40.85 
 
 		 184 aa  91.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  36.14 
 
 		 930 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  40.88 
 
 		 675 aa  90.1  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  40.35 
 
 		 819 aa  90.1  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  40.12 
 
 		 500 aa  90.1  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  39.88 
 
 		 791 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  40.62 
 
 		 1667 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  40.62 
 
 		 752 aa  89  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  33.04 
 
 		 848 aa  88.6  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  30.8 
 
 		 1667 aa  88.2  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  52.44 
 
 		 1311 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  36.65 
 
 		 777 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  36.9 
 
 		 679 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  36.9 
 
 		 581 aa  87  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  33.49 
 
 		 1380 aa  85.9  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  40.62 
 
 		 685 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  37.65 
 
 		 551 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  38.69 
 
 		 1094 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.24 
 
 		 802 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  36.97 
 
 		 713 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  38.46 
 
 		 561 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  40.51 
 
 		 816 aa  84  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  36.9 
 
 		 930 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  36.9 
 
 		 735 aa  82.4  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  37.06 
 
 		 658 aa  82.4  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  36.75 
 
 		 408 aa  82.4  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  35.33 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  39.29 
 
 		 996 aa  81.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  39.29 
 
 		 1528 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  37.3 
 
 		 684 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  39.31 
 
 		 769 aa  80.5  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  36.14 
 
 		 1783 aa  80.1  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  54.17 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  36.42 
 
 		 958 aa  79  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  37.35 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  35.93 
 
 		 838 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  35.16 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  36.84 
 
 		 1231 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  31.84 
 
 		 1387 aa  72.8  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  38.1 
 
 		 1531 aa  73.2  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  42.86 
 
 		 2065 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  34.94 
 
 		 644 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  36.25 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  35.47 
 
 		 865 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  35.8 
 
 		 560 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  38.54 
 
 		 810 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  47.19 
 
 		 1830 aa  70.1  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  45.33 
 
 		 1096 aa  70.5  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  34.18 
 
 		 815 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  34.62 
 
 		 1292 aa  69.7  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0510  hypothetical protein  35.22 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.644592 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>