275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2569 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  100 
 
 
505 aa  1006    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  52.84 
 
 
735 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  47.09 
 
 
471 aa  355  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  33.08 
 
 
810 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  44.32 
 
 
940 aa  200  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  38.72 
 
 
635 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  41.4 
 
 
1001 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  48.04 
 
 
641 aa  177  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  37.9 
 
 
871 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  37.12 
 
 
960 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.95 
 
 
547 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  33.89 
 
 
1092 aa  160  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  37.97 
 
 
375 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  34.4 
 
 
525 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  42.57 
 
 
245 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  34.31 
 
 
838 aa  137  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  35.67 
 
 
1931 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  35.79 
 
 
777 aa  134  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  28.89 
 
 
1056 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  40.89 
 
 
352 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  43.02 
 
 
595 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  35.4 
 
 
297 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  29.1 
 
 
1300 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  34.9 
 
 
1035 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  39.36 
 
 
564 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  42.86 
 
 
153 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  39.34 
 
 
638 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  36.42 
 
 
409 aa  106  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  29.26 
 
 
1969 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  31.86 
 
 
500 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.27 
 
 
458 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  33.18 
 
 
831 aa  100  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  32.45 
 
 
341 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  39.56 
 
 
360 aa  100  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  26.88 
 
 
978 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  40.1 
 
 
302 aa  97.4  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  44.22 
 
 
954 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  34.26 
 
 
570 aa  92.4  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  30.62 
 
 
724 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  31.7 
 
 
461 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.29 
 
 
2272 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 
1121 aa  87.8  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.65 
 
 
709 aa  87  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.67 
 
 
1682 aa  87  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  34.03 
 
 
433 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.19 
 
 
510 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  45.92 
 
 
2036 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  30.63 
 
 
648 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  32.72 
 
 
810 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  50 
 
 
2000 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  47 
 
 
1667 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  44.64 
 
 
2122 aa  84  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  31.94 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  42.42 
 
 
1120 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 
697 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  35.33 
 
 
275 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  30.35 
 
 
749 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  41.55 
 
 
919 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  44.55 
 
 
1842 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  34.41 
 
 
698 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  28.66 
 
 
805 aa  80.5  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  39.69 
 
 
1882 aa  80.1  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  50.62 
 
 
938 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3145  hypothetical protein  50 
 
 
1096 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.404826  normal  0.106206 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  32.99 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  38.79 
 
 
575 aa  77  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2113  cell surface protein  40.43 
 
 
725 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.103352  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  40.18 
 
 
1241 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  46.15 
 
 
1311 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  47.67 
 
 
771 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  27.89 
 
 
892 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  44.3 
 
 
2065 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  30.33 
 
 
820 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  47.44 
 
 
861 aa  73.9  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  29.71 
 
 
400 aa  73.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  52.27 
 
 
1356 aa  73.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  28.07 
 
 
707 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  47.19 
 
 
1732 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  36.88 
 
 
840 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  40.22 
 
 
530 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  28.57 
 
 
899 aa  70.9  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  47.06 
 
 
930 aa  70.5  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  45.57 
 
 
1328 aa  70.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  49.4 
 
 
819 aa  70.9  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  46.67 
 
 
525 aa  70.5  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.67 
 
 
1862 aa  70.1  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  30 
 
 
620 aa  70.1  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  29.51 
 
 
3295 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  27.85 
 
 
501 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  38.94 
 
 
1387 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  44.3 
 
 
1830 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  45.45 
 
 
528 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  45.88 
 
 
561 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  30.33 
 
 
1200 aa  68.6  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  43.3 
 
 
460 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 
2554 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  44.12 
 
 
1236 aa  67.8  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  49.41 
 
 
500 aa  67  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  43.69 
 
 
677 aa  66.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  44 
 
 
802 aa  65.5  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>