More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0970 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0970  PKD  100 
 
 
1528 aa  3060    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  35.53 
 
 
1667 aa  536  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  35.67 
 
 
1094 aa  460  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  33.3 
 
 
1361 aa  456  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  36.21 
 
 
1862 aa  436  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  36.65 
 
 
2272 aa  414  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  32.33 
 
 
1667 aa  386  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  43.17 
 
 
1842 aa  355  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  33.91 
 
 
941 aa  341  7e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  40.9 
 
 
1682 aa  335  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  28.9 
 
 
1282 aa  333  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  41.03 
 
 
978 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  40.4 
 
 
963 aa  324  8e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  32.72 
 
 
1236 aa  318  6e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  41.94 
 
 
752 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  38.05 
 
 
561 aa  303  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  43.81 
 
 
1882 aa  298  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  43.17 
 
 
2036 aa  296  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  42.34 
 
 
735 aa  294  9e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  41.06 
 
 
2122 aa  293  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  31.89 
 
 
1783 aa  292  4e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  39.95 
 
 
528 aa  291  8e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  41.2 
 
 
575 aa  291  8e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  40.24 
 
 
1356 aa  290  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  35.77 
 
 
838 aa  282  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  40.89 
 
 
2000 aa  281  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  40.42 
 
 
2554 aa  280  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  29.81 
 
 
1387 aa  278  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  41.62 
 
 
1300 aa  263  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  35.46 
 
 
930 aa  262  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  28.94 
 
 
1011 aa  261  7e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  29.11 
 
 
2176 aa  259  3e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  28.11 
 
 
1814 aa  258  8e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  41.76 
 
 
679 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  36.93 
 
 
530 aa  255  5.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  46.53 
 
 
1241 aa  254  7e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  37.47 
 
 
958 aa  254  7e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  38.79 
 
 
713 aa  251  9e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  42.6 
 
 
669 aa  251  9e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  42.57 
 
 
675 aa  250  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  40.32 
 
 
1969 aa  251  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  39.52 
 
 
859 aa  250  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  26.78 
 
 
1606 aa  246  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  42.61 
 
 
1120 aa  247  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  28.42 
 
 
952 aa  244  7e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  38.86 
 
 
685 aa  239  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  38.52 
 
 
658 aa  239  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  37.91 
 
 
1732 aa  226  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.66 
 
 
1602 aa  222  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  29.42 
 
 
865 aa  221  7e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  37.25 
 
 
460 aa  213  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  44.58 
 
 
551 aa  210  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  37.36 
 
 
861 aa  210  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  45.49 
 
 
791 aa  208  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  27.18 
 
 
1620 aa  204  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  42.62 
 
 
581 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  43.46 
 
 
3295 aa  199  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  37.22 
 
 
869 aa  197  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  39.26 
 
 
910 aa  196  3e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  39.48 
 
 
615 aa  191  7e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  38.36 
 
 
547 aa  191  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  35.34 
 
 
971 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  36.44 
 
 
1292 aa  184  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  37.36 
 
 
929 aa  182  5.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  38.94 
 
 
840 aa  181  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  36.98 
 
 
870 aa  179  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  37.33 
 
 
719 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.61 
 
 
845 aa  174  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  37.77 
 
 
802 aa  174  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  34.56 
 
 
823 aa  170  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  41.99 
 
 
2552 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.38 
 
 
777 aa  164  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  38.04 
 
 
930 aa  159  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  35.27 
 
 
819 aa  159  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  29.72 
 
 
1531 aa  159  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 
786 aa  159  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  36.18 
 
 
519 aa  157  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  37.63 
 
 
1095 aa  155  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  28.46 
 
 
734 aa  152  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  33.78 
 
 
443 aa  152  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  44.38 
 
 
184 aa  149  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  43.53 
 
 
644 aa  145  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  42.53 
 
 
560 aa  141  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  47.93 
 
 
816 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.98 
 
 
439 aa  139  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  24.26 
 
 
1466 aa  139  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  27.34 
 
 
1057 aa  137  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  43.03 
 
 
500 aa  135  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  33.33 
 
 
1189 aa  135  6e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  31.09 
 
 
938 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  31.51 
 
 
1987 aa  129  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  44.31 
 
 
1311 aa  128  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  36.27 
 
 
848 aa  128  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  41.62 
 
 
400 aa  125  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  36.94 
 
 
408 aa  125  9e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  27.64 
 
 
1380 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  47.02 
 
 
1231 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  32.01 
 
 
517 aa  121  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  41.67 
 
 
769 aa  121  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  34.78 
 
 
586 aa  121  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.497702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>