More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2066 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 870 aa  1752    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  72.19 
 
 		 840 aa  721    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  62.91 
 
 		 823 aa  666    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  76.4 
 
 		 845 aa  791    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  68.34 
 
 		 819 aa  728    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  71.95 
 
 		 719 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  63.42 
 
 		 1356 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  50.93 
 
 		 2554 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  51.92 
 
 		 3295 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  75.37 
 
 		 777 aa  389  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  46.3 
 
 		 802 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  67.71 
 
 		 786 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  76.1 
 
 		 1380 aa  377  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  58.43 
 
 		 1732 aa  362  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  36.61 
 
 		 1387 aa  243  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  39.71 
 
 		 1094 aa  231  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  39.78 
 
 		 1667 aa  229  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  43.66 
 
 		 930 aa  219  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  38.78 
 
 		 859 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  40 
 
 		 713 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  40.1 
 
 		 1842 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  39.34 
 
 		 669 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  40 
 
 		 561 aa  214  7e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  39.39 
 
 		 2036 aa  214  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  38.74 
 
 		 735 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  39.3 
 
 		 679 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  39.29 
 
 		 2122 aa  213  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  39.76 
 
 		 752 aa  212  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  37.77 
 
 		 2272 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  40.88 
 
 		 575 aa  210  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  37.97 
 
 		 1282 aa  209  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  38.4 
 
 		 1361 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  32.84 
 
 		 685 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  38.11 
 
 		 675 aa  206  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  38.62 
 
 		 1862 aa  205  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  39.48 
 
 		 1300 aa  205  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  48.5 
 
 		 530 aa  204  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  39.31 
 
 		 528 aa  203  9e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  40.73 
 
 		 963 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  39.68 
 
 		 2000 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  38.46 
 
 		 1882 aa  202  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  39.24 
 
 		 1682 aa  201  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  40.84 
 
 		 551 aa  196  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  41.33 
 
 		 1120 aa  196  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  44 
 
 		 547 aa  196  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  37.59 
 
 		 978 aa  195  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  38.17 
 
 		 1241 aa  194  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  38.81 
 
 		 1969 aa  194  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  37.04 
 
 		 861 aa  194  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  39.09 
 
 		 658 aa  190  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  42.56 
 
 		 791 aa  189  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  43.16 
 
 		 581 aa  188  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  35.9 
 
 		 838 aa  187  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  38.22 
 
 		 460 aa  185  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  38.89 
 
 		 941 aa  184  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  42.05 
 
 		 1236 aa  182  2e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  46.03 
 
 		 958 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  39.52 
 
 		 1667 aa  181  7e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  46.46 
 
 		 966 aa  180  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  36.98 
 
 		 1528 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  41.79 
 
 		 930 aa  178  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  40.64 
 
 		 615 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  42.97 
 
 		 910 aa  173  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  37.22 
 
 		 869 aa  171  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  56.25 
 
 		 735 aa  163  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  45.18 
 
 		 848 aa  156  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  52.56 
 
 		 581 aa  155  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  38.1 
 
 		 971 aa  154  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  49.16 
 
 		 627 aa  153  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  44.35 
 
 		 2552 aa  152  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  53.42 
 
 		 1799 aa  152  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  41.5 
 
 		 1234 aa  151  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  31.61 
 
 		 952 aa  147  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  33.91 
 
 		 1292 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  49.69 
 
 		 1262 aa  145  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  45 
 
 		 644 aa  144  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  47.8 
 
 		 522 aa  141  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  46.95 
 
 		 954 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  44.71 
 
 		 184 aa  138  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  34.53 
 
 		 439 aa  138  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  40.08 
 
 		 443 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  47.19 
 
 		 816 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  43.36 
 
 		 1035 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  39.84 
 
 		 938 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  37.85 
 
 		 1095 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  43.09 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  36.86 
 
 		 1189 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  31 
 
 		 929 aa  132  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  44.69 
 
 		 930 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  48.95 
 
 		 749 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  48.68 
 
 		 919 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  44.52 
 
 		 1931 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  46.25 
 
 		 519 aa  127  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  42.22 
 
 		 1231 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  31.22 
 
 		 2176 aa  125  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  46.75 
 
 		 801 aa  125  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  40.66 
 
 		 500 aa  124  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  34.01 
 
 		 865 aa  124  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  37.44 
 
 		 1295 aa  124  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.75 
 
 		 933 aa  122  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>