177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0431 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 966 aa  1850    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  42.34 
 
 		 1387 aa  297  6e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  35.45 
 
 		 930 aa  220  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  38.73 
 
 		 1356 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  37.09 
 
 		 840 aa  208  4e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  37.71 
 
 		 1234 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  40.72 
 
 		 2554 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  38.34 
 
 		 1799 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  40.52 
 
 		 1380 aa  197  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  35.43 
 
 		 1262 aa  195  3e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 		 870 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  38.03 
 
 		 1035 aa  191  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  32.62 
 
 		 823 aa  191  7e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.01 
 
 		 845 aa  185  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  34.47 
 
 		 954 aa  164  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  46.01 
 
 		 777 aa  140  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  45.51 
 
 		 802 aa  137  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  46.53 
 
 		 819 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  44.76 
 
 		 3295 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  43.35 
 
 		 739 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  30.03 
 
 		 918 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  27.37 
 
 		 1132 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  43.54 
 
 		 719 aa  127  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  41.53 
 
 		 1732 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.61 
 
 		 786 aa  125  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  38.01 
 
 		 875 aa  118  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  43.83 
 
 		 627 aa  118  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  42.77 
 
 		 919 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  26.96 
 
 		 1338 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  29.8 
 
 		 569 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  30.55 
 
 		 526 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  43.15 
 
 		 735 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  41.92 
 
 		 522 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.82 
 
 		 1321 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  40.56 
 
 		 581 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  36.39 
 
 		 930 aa  111  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  28.12 
 
 		 861 aa  110  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  26.99 
 
 		 982 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  42.13 
 
 		 749 aa  110  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  42.18 
 
 		 801 aa  108  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  37.44 
 
 		 627 aa  108  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  32.14 
 
 		 1707 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0739  PKD domain containing protein  70.83 
 
 		 877 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.000357401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  40.98 
 
 		 468 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  31.69 
 
 		 1004 aa  101  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  38.06 
 
 		 524 aa  97.8  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  34.36 
 
 		 630 aa  95.9  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.88 
 
 		 933 aa  94.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  35.53 
 
 		 855 aa  92  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  33.57 
 
 		 948 aa  90.5  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  32.48 
 
 		 460 aa  89.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  30.73 
 
 		 1094 aa  83.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1682 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  30.61 
 
 		 963 aa  83.2  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  31.25 
 
 		 550 aa  82.8  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  32.28 
 
 		 1024 aa  82  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  26.87 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  30.47 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  30.19 
 
 		 675 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  32.8 
 
 		 972 aa  79.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  30.03 
 
 		 713 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1282 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  26.78 
 
 		 859 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  26.65 
 
 		 978 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  30.4 
 
 		 679 aa  78.2  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  29.75 
 
 		 735 aa  78.2  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  29.5 
 
 		 658 aa  77.4  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  30.73 
 
 		 669 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  34.23 
 
 		 798 aa  75.5  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  31.9 
 
 		 500 aa  75.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  26.28 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  32.67 
 
 		 726 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.93 
 
 		 2036 aa  72  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  33.55 
 
 		 1295 aa  71.2  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  28.98 
 
 		 685 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  29.58 
 
 		 615 aa  70.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1167 aa  70.5  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  28.86 
 
 		 910 aa  70.5  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  31.91 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  27.81 
 
 		 1667 aa  69.3  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  41.41 
 
 		 869 aa  68.6  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  25.82 
 
 		 1987 aa  68.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  25.99 
 
 		 1862 aa  68.2  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  28.37 
 
 		 1300 aa  68.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  28.53 
 
 		 1882 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  26.4 
 
 		 1095 aa  67.4  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  34.84 
 
 		 461 aa  67.8  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  27.73 
 
 		 581 aa  67  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  33.11 
 
 		 887 aa  65.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  36.19 
 
 		 863 aa  65.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  26.22 
 
 		 2272 aa  65.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  28.76 
 
 		 940 aa  65.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  27.69 
 
 		 1842 aa  65.1  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  29.55 
 
 		 1969 aa  65.1  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  32.73 
 
 		 673 aa  65.1  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  25.77 
 
 		 2122 aa  63.9  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  25.94 
 
 		 575 aa  62.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  33.91 
 
 		 383 aa  62.4  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  26.98 
 
 		 958 aa  62  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  27.2 
 
 		 752 aa  62  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>