248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1051 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  100 
 
 		 1295 aa  2628    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  40.73 
 
 		 1577 aa  351  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  51.16 
 
 		 1247 aa  301  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  50.87 
 
 		 1217 aa  296  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  50.29 
 
 		 1585 aa  295  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  50 
 
 		 1474 aa  293  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  51.41 
 
 		 1275 aa  290  1e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  46.88 
 
 		 1748 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  49.11 
 
 		 1002 aa  280  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  52.11 
 
 		 1160 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  39.72 
 
 		 1414 aa  177  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  30.4 
 
 		 1152 aa  164  9e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  39.13 
 
 		 1132 aa  164  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  55.32 
 
 		 1206 aa  155  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  46.88 
 
 		 801 aa  147  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  54.61 
 
 		 1236 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  48.15 
 
 		 601 aa  135  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  32.22 
 
 		 550 aa  131  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  36.36 
 
 		 970 aa  129  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  35.95 
 
 		 1479 aa  127  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  41.88 
 
 		 524 aa  125  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  38.12 
 
 		 1108 aa  125  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  44.6 
 
 		 693 aa  124  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  45.33 
 
 		 1193 aa  120  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.6 
 
 		 823 aa  119  5e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.47 
 
 		 845 aa  118  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  48.84 
 
 		 812 aa  117  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  37 
 
 		 1356 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  43.61 
 
 		 1424 aa  115  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  35.36 
 
 		 870 aa  115  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  38.62 
 
 		 802 aa  115  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  41.61 
 
 		 918 aa  114  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  32.46 
 
 		 815 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  42.55 
 
 		 1288 aa  112  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  36.09 
 
 		 1380 aa  112  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  36 
 
 		 840 aa  110  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.04 
 
 		 819 aa  109  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  56.52 
 
 		 1362 aa  108  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.18 
 
 		 933 aa  108  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3712  Beta-galactosidase  42.03 
 
 		 1392 aa  108  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173046  normal  0.0203648 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  39.66 
 
 		 1329 aa  107  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  39.44 
 
 		 3793 aa  107  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  38.87 
 
 		 1266 aa  106  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  38.36 
 
 		 972 aa  106  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  43.56 
 
 		 786 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  29.32 
 
 		 1004 aa  102  5e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  41.14 
 
 		 719 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  40.24 
 
 		 1657 aa  99.4  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  32.72 
 
 		 798 aa  98.2  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  30.59 
 
 		 991 aa  98.2  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  37.7 
 
 		 2142 aa  98.6  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  30.67 
 
 		 1167 aa  97.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  33.77 
 
 		 1732 aa  97.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  38.22 
 
 		 581 aa  97.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  37.65 
 
 		 1035 aa  96.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  46.67 
 
 		 1406 aa  97.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  38.36 
 
 		 855 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  33.77 
 
 		 2554 aa  96.3  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2289  glycosy hydrolase family protein  39.58 
 
 		 1069 aa  95.5  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  28.34 
 
 		 982 aa  94.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  39.13 
 
 		 1799 aa  93.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1044  Alpha-galactosidase  40.74 
 
 		 693 aa  93.6  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  37.5 
 
 		 954 aa  93.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  35.98 
 
 		 1262 aa  94  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  38.06 
 
 		 948 aa  93.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  36.49 
 
 		 526 aa  92.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  35.88 
 
 		 2270 aa  92  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  38.41 
 
 		 777 aa  92  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.27 
 
 		 984 aa  91.7  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  35.93 
 
 		 1338 aa  91.7  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  33.82 
 
 		 1193 aa  91.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  37.33 
 
 		 1024 aa  91.3  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  39.38 
 
 		 1234 aa  91.3  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1489  F5/8 type C domain-containing protein  36.32 
 
 		 1687 aa  90.9  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  32.89 
 
 		 3295 aa  89.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  37.89 
 
 		 468 aa  89.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  32.97 
 
 		 930 aa  89.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  32.88 
 
 		 2713 aa  88.6  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.84 
 
 		 915 aa  88.6  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1278  leucine rich repeat domain-containing protein  36.32 
 
 		 1465 aa  88.6  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0180436  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.02 
 
 		 979 aa  88.2  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  35.44 
 
 		 875 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  35.67 
 
 		 919 aa  87.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.54 
 
 		 1321 aa  87.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  38.93 
 
 		 1707 aa  86.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  30.96 
 
 		 735 aa  84.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  36.84 
 
 		 749 aa  84  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  43.43 
 
 		 1123 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  36.97 
 
 		 639 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  42.98 
 
 		 726 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  50.55 
 
 		 778 aa  83.2  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  31.65 
 
 		 1387 aa  83.2  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  29.91 
 
 		 610 aa  81.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 739 aa  81.6  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  34 
 
 		 630 aa  80.1  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  37.61 
 
 		 703 aa  80.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  32.62 
 
 		 627 aa  80.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  38.39 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  30.37 
 
 		 503 aa  76.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  28.57 
 
 		 863 aa  76.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>