141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1344 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  73.58 
 
 		 919 aa  964    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 954 aa  1920    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  32.57 
 
 		 1035 aa  283  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  41.44 
 
 		 1234 aa  214  9e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  40.9 
 
 		 1262 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  41.74 
 
 		 1799 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  50.8 
 
 		 627 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  38.12 
 
 		 930 aa  181  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  41.03 
 
 		 749 aa  173  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  40.83 
 
 		 569 aa  167  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  50.27 
 
 		 627 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  52.2 
 
 		 735 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  45.93 
 
 		 581 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  34.16 
 
 		 982 aa  159  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  36.34 
 
 		 918 aa  157  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  32.72 
 
 		 526 aa  146  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  32.93 
 
 		 1338 aa  144  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.13 
 
 		 1321 aa  143  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  45.69 
 
 		 468 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  55.48 
 
 		 845 aa  142  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  55.48 
 
 		 1356 aa  138  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  34.55 
 
 		 1707 aa  138  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  54.55 
 
 		 1380 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  50.34 
 
 		 870 aa  137  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  53.69 
 
 		 777 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0626  hypothetical protein  75.86 
 
 		 401 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.110542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  55.17 
 
 		 819 aa  135  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 823 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  49.32 
 
 		 719 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  50 
 
 		 840 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  43.09 
 
 		 802 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  47.37 
 
 		 1732 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  46.41 
 
 		 2554 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  31.34 
 
 		 433 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  46.41 
 
 		 3295 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  45.28 
 
 		 786 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  45.96 
 
 		 522 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  44.44 
 
 		 875 aa  121  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  40.78 
 
 		 966 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  30.56 
 
 		 461 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  27.09 
 
 		 595 aa  115  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  35.5 
 
 		 1387 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  44.3 
 
 		 739 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  33.49 
 
 		 801 aa  110  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  33.45 
 
 		 1167 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0739  PKD domain containing protein  58.62 
 
 		 877 aa  108  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.000357401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  29.46 
 
 		 709 aa  108  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  28.13 
 
 		 1056 aa  106  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  28.12 
 
 		 724 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  42.96 
 
 		 948 aa  103  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  26.93 
 
 		 630 aa  102  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.18 
 
 		 933 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  33.47 
 
 		 635 aa  99.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  31.98 
 
 		 877 aa  99.8  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  30.72 
 
 		 610 aa  98.6  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  36.12 
 
 		 1001 aa  97.8  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  28.77 
 
 		 1391 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1024 aa  95.9  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  26.6 
 
 		 863 aa  95.9  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  36.88 
 
 		 1295 aa  93.6  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 		 1121 aa  93.2  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  36.19 
 
 		 810 aa  91.7  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  27.57 
 
 		 673 aa  91.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  39.29 
 
 		 550 aa  91.7  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  40.52 
 
 		 641 aa  88.2  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  37.14 
 
 		 471 aa  87  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  36.77 
 
 		 524 aa  86.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  36.31 
 
 		 500 aa  86.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  36.05 
 
 		 1004 aa  85.5  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  39.33 
 
 		 798 aa  85.5  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  38.58 
 
 		 855 aa  84.7  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  46.59 
 
 		 564 aa  84.3  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  27.56 
 
 		 467 aa  84  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  42.34 
 
 		 1132 aa  83.2  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  32.42 
 
 		 547 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  42.86 
 
 		 1092 aa  80.5  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  35.76 
 
 		 245 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  42.36 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  29.51 
 
 		 940 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  42.98 
 
 		 735 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.66 
 
 		 614 aa  77  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  31.22 
 
 		 1931 aa  77  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  59.38 
 
 		 871 aa  76.3  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  23.75 
 
 		 1091 aa  75.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  28.57 
 
 		 638 aa  75.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  39.35 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  31.79 
 
 		 972 aa  75.1  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  27.32 
 
 		 831 aa  75.1  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  43.62 
 
 		 960 aa  72.4  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  30.77 
 
 		 620 aa  70.5  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  46.07 
 
 		 838 aa  68.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  31.76 
 
 		 705 aa  68.6  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  22.99 
 
 		 892 aa  67  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  32.5 
 
 		 375 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  24.9 
 
 		 720 aa  63.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  33.9 
 
 		 869 aa  63.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  27.37 
 
 		 697 aa  63.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3237  cellulase  29.93 
 
 		 630 aa  62.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000087335  normal  0.349209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  35.56 
 
 		 639 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.91 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>