138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2671 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 581 aa  1189    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2753  peptidase C1A papain  42.88 
 
 		 561 aa  435  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.757043  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  45.38 
 
 		 930 aa  430  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  33.5 
 
 		 698 aa  266  8e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  32.13 
 
 		 697 aa  264  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  55.36 
 
 		 468 aa  253  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  51.74 
 
 		 627 aa  252  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  54.3 
 
 		 735 aa  248  2e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  48.47 
 
 		 919 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  52.97 
 
 		 749 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  47.31 
 
 		 522 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.95 
 
 		 1085 aa  231  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  45.45 
 
 		 1234 aa  160  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  45.93 
 
 		 954 aa  160  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  53.25 
 
 		 802 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  55.07 
 
 		 1799 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  54.36 
 
 		 819 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  53.69 
 
 		 870 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  54.05 
 
 		 1356 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  54.05 
 
 		 845 aa  152  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  52.29 
 
 		 823 aa  150  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  49.68 
 
 		 786 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  50.67 
 
 		 1380 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  48.17 
 
 		 777 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  39.91 
 
 		 1732 aa  143  9e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  48.65 
 
 		 719 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  51.35 
 
 		 840 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  49.66 
 
 		 1035 aa  140  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  38.99 
 
 		 2554 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  39.45 
 
 		 3295 aa  139  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  48.15 
 
 		 1262 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  42 
 
 		 875 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  68.49 
 
 		 930 aa  120  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  68.49 
 
 		 387 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  69.86 
 
 		 668 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  43.05 
 
 		 801 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  72.86 
 
 		 579 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  43.05 
 
 		 1387 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  43.66 
 
 		 848 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  67.12 
 
 		 488 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  62.22 
 
 		 787 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  75.36 
 
 		 676 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  73.24 
 
 		 403 aa  114  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  66.22 
 
 		 709 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  72.86 
 
 		 958 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  59.74 
 
 		 831 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.99 
 
 		 933 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  62.67 
 
 		 869 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  44.1 
 
 		 627 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  40.91 
 
 		 966 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  38.12 
 
 		 1338 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  36.99 
 
 		 982 aa  106  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  40 
 
 		 798 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  39.16 
 
 		 526 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  57.89 
 
 		 294 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.75 
 
 		 1321 aa  103  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  62.86 
 
 		 298 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1444  PKD domain containing protein  60.76 
 
 		 479 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  52.33 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  56 
 
 		 739 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  60.27 
 
 		 390 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  39.47 
 
 		 918 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  36.57 
 
 		 391 aa  100  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  68.75 
 
 		 1056 aa  100  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  37.58 
 
 		 630 aa  99.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  52.75 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2292  hypothetical protein  62.32 
 
 		 110 aa  97.8  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.352852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  38.22 
 
 		 1295 aa  97.4  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  62.86 
 
 		 343 aa  97.1  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  37.41 
 
 		 948 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  42.18 
 
 		 1004 aa  95.5  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  61.19 
 
 		 361 aa  94.7  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  42.45 
 
 		 524 aa  94.4  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  42.96 
 
 		 1167 aa  94  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2277  hypothetical protein  53.33 
 
 		 389 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.244625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.68 
 
 		 547 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201749  normal  0.0862091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  36.96 
 
 		 550 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  39.04 
 
 		 1024 aa  90.9  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  35.43 
 
 		 855 aa  90.5  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  37.59 
 
 		 569 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  39.26 
 
 		 1707 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  35.29 
 
 		 972 aa  83.6  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  43.62 
 
 		 1132 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  38.06 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2459  beta-lactamase domain protein  49.25 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 		 1091 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  29.79 
 
 		 610 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  51.52 
 
 		 595 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  32.92 
 
 		 863 aa  71.6  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  32.9 
 
 		 590 aa  70.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  30.82 
 
 		 1391 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 		 639 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  30.16 
 
 		 726 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  31.85 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.7 
 
 		 491 aa  67  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0894  hypothetical protein  43.55 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7858  normal  0.169635 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  44.12 
 
 		 883 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  35.64 
 
 		 461 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  44.29 
 
 		 884 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  42.65 
 
 		 887 aa  64.7  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>