94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0686 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 461 aa  929    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  35.6 
 
 		 1035 aa  241  2e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  35.96 
 
 		 1931 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  35.6 
 
 		 749 aa  192  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  41.26 
 
 		 838 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  30.03 
 
 		 810 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  29.59 
 
 		 698 aa  132  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  29.43 
 
 		 919 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  31.77 
 
 		 777 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  28.37 
 
 		 1056 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  29.51 
 
 		 697 aa  124  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  30.56 
 
 		 954 aa  124  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  28.66 
 
 		 724 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  29.9 
 
 		 709 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  30.51 
 
 		 620 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  37 
 
 		 595 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  37.5 
 
 		 1799 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  36.18 
 
 		 930 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  35.85 
 
 		 375 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  42.42 
 
 		 1121 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  29.19 
 
 		 735 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  37.41 
 
 		 735 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  34.74 
 
 		 810 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  39.47 
 
 		 547 aa  84  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  30.61 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  36.03 
 
 		 1732 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  37.33 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  36.67 
 
 		 1234 aa  80.5  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  35.43 
 
 		 805 aa  80.1  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  31.63 
 
 		 1092 aa  79.7  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  36.03 
 
 		 2554 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  28.24 
 
 		 638 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  33.75 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  37.31 
 
 		 1380 aa  77  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  36.76 
 
 		 870 aa  77  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 623 aa  77  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.717287  normal  0.669821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  35.11 
 
 		 1356 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  37.6 
 
 		 564 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  30.94 
 
 		 940 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  36.3 
 
 		 819 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  34.56 
 
 		 3295 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  32.16 
 
 		 627 aa  75.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.57 
 
 		 845 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  34.92 
 
 		 786 aa  75.1  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  31.19 
 
 		 831 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  32.87 
 
 		 1262 aa  73.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  33.52 
 
 		 823 aa  73.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.38 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1001 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  31.35 
 
 		 892 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  32 
 
 		 820 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  30.57 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  36.75 
 
 		 471 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  32.95 
 
 		 802 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  31.17 
 
 		 1004 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  31.07 
 
 		 635 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  35.95 
 
 		 1387 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 840 aa  70.9  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  34.84 
 
 		 966 aa  70.5  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  37.12 
 
 		 719 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  33.73 
 
 		 245 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  28.57 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  46.59 
 
 		 960 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  36.17 
 
 		 641 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.77 
 
 		 933 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  53.97 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  34.15 
 
 		 581 aa  65.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  32.58 
 
 		 875 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  30.43 
 
 		 871 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  35.46 
 
 		 801 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  33.57 
 
 		 524 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  33.12 
 
 		 982 aa  61.6  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  35.42 
 
 		 739 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  37.18 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  27.17 
 
 		 720 aa  58.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  34.09 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  39.36 
 
 		 948 aa  58.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  36.9 
 
 		 1132 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  37.08 
 
 		 918 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  32.48 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  29.27 
 
 		 630 aa  53.5  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  30.43 
 
 		 1295 aa  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.2 
 
 		 1321 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.07 
 
 		 746 aa  51.6  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  47.37 
 
 		 582 aa  50.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  31.76 
 
 		 1338 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  36.78 
 
 		 590 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0487  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.73 
 
 		 254 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2052  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.88 
 
 		 491 aa  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  30.23 
 
 		 855 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  35 
 
 		 1707 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  26.11 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.33 
 
 		 230 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  33 
 
 		 972 aa  43.5  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>