142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1397 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  100 
 
 		 805 aa  1574    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  54.88 
 
 		 831 aa  717    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  81.24 
 
 		 892 aa  1142    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  83.96 
 
 		 820 aa  1191    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  33.66 
 
 		 564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 1121 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  29.06 
 
 		 595 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  28.17 
 
 		 1001 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  31.45 
 
 		 940 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  25.67 
 
 		 1931 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  30.83 
 
 		 777 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  30.04 
 
 		 641 aa  99.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  32.2 
 
 		 810 aa  92  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.75 
 
 		 510 aa  90.1  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  30.92 
 
 		 471 aa  89.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  34.03 
 
 		 1092 aa  87.8  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  27.19 
 
 		 871 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  33.15 
 
 		 635 aa  81.6  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  31.56 
 
 		 735 aa  81.3  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  26.78 
 
 		 5743 aa  79  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  33.72 
 
 		 375 aa  77  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  31.88 
 
 		 620 aa  74.3  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  28.04 
 
 		 810 aa  73.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  31.87 
 
 		 547 aa  73.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  26.78 
 
 		 1035 aa  72.4  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  25.39 
 
 		 1332 aa  72  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.09 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  35.09 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  28.94 
 
 		 461 aa  70.5  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  26.02 
 
 		 1056 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  26.87 
 
 		 2552 aa  69.3  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  43.62 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  25.43 
 
 		 724 aa  68.6  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0828  cell wall anchor domain-containing protein  59.57 
 
 		 969 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0871  cell wall anchor domain-containing protein  59.57 
 
 		 969 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  27.21 
 
 		 638 aa  67.8  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  26.81 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.81 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.81 
 
 		 416 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0962  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  53.15 
 
 		 971 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  24.79 
 
 		 954 aa  66.6  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  26.81 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  25.63 
 
 		 675 aa  64.7  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  31.27 
 
 		 352 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  26.94 
 
 		 400 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  33.75 
 
 		 365 aa  63.9  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  43.36 
 
 		 1088 aa  63.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  24.33 
 
 		 919 aa  62.4  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0776  collagen-binding surface protein  51.54 
 
 		 913 aa  62  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133047  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  33.68 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21200  copper binding protein, plastocyanin/azurin family  27.15 
 
 		 513 aa  59.7  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229231  normal  0.551456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  31.03 
 
 		 570 aa  60.1  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  32.35 
 
 		 14944 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  23.82 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  30.23 
 
 		 1025 aa  59.7  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  28.06 
 
 		 1200 aa  59.3  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  29.8 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  30.67 
 
 		 647 aa  58.5  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  23.44 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  25.56 
 
 		 499 aa  58.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  31.7 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.71 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0164  acetate permease  27.85 
 
 		 138 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  29.9 
 
 		 1224 aa  57.4  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.93 
 
 		 458 aa  57.4  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  20.26 
 
 		 1152 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  26.67 
 
 		 1242 aa  57  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  28.31 
 
 		 707 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0415  multiple banded antigen  24.09 
 
 		 423 aa  57  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  32.9 
 
 		 382 aa  56.6  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.71 
 
 		 230 aa  55.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10920  Mannuronan C-5-Epimerase  31.69 
 
 		 526 aa  55.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  22.94 
 
 		 614 aa  54.3  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  28.23 
 
 		 3242 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  23.85 
 
 		 483 aa  53.9  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  23.53 
 
 		 838 aa  53.9  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.17 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  27.37 
 
 		 341 aa  53.1  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  29.27 
 
 		 812 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  26.97 
 
 		 12684 aa  53.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  38.57 
 
 		 297 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1406 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  25.94 
 
 		 505 aa  51.6  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.69 
 
 		 1919 aa  52  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  23.63 
 
 		 2350 aa  52  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  25 
 
 		 960 aa  51.6  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  24.91 
 
 		 1096 aa  51.6  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.7 
 
 		 626 aa  51.2  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.93 
 
 		 677 aa  51.2  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  34.72 
 
 		 938 aa  51.2  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0234  hypothetical protein  44.12 
 
 		 128 aa  50.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000287276  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  44.27 
 
 		 848 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  24.21 
 
 		 698 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  22.35 
 
 		 422 aa  49.7  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0032  rhodanese-like protein  50 
 
 		 248 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  29.63 
 
 		 5453 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  26.76 
 
 		 749 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  25.64 
 
 		 437 aa  50.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1238  alginate biosynthesis protein AlgG  29.85 
 
 		 536 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  28.65 
 
 		 446 aa  49.3  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>