89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0279 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 458 aa  899    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  30.91 
 
 		 570 aa  167  4e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  36.83 
 
 		 352 aa  159  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  40.84 
 
 		 302 aa  153  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  37.55 
 
 		 638 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  38.67 
 
 		 409 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  38.34 
 
 		 341 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  38.06 
 
 		 1200 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  41.54 
 
 		 153 aa  106  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  34.33 
 
 		 500 aa  104  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  35.16 
 
 		 471 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  35.45 
 
 		 735 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  32.22 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  31.27 
 
 		 641 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1114  hypothetical protein  38.67 
 
 		 143 aa  89.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  42.69 
 
 		 505 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1001 aa  87.8  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  33.82 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  33.73 
 
 		 871 aa  80.5  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  29.89 
 
 		 635 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32 
 
 		 677 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1444  hypothetical protein  40.2 
 
 		 160 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.261794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  31.38 
 
 		 960 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  28.51 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 		 1931 aa  73.9  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  44.8 
 
 		 525 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  32.91 
 
 		 647 aa  69.3  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.32 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  25.1 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.79 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  32.18 
 
 		 550 aa  63.9  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  34.05 
 
 		 810 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.18 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  24.83 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  32.3 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.73 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  24.07 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.73 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  27.55 
 
 		 308 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  25.15 
 
 		 564 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  26.3 
 
 		 863 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  24.42 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  24.42 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  33.82 
 
 		 365 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  23.73 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  29.19 
 
 		 940 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.49 
 
 		 685 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  26.28 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  26.62 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  33.53 
 
 		 820 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  36.36 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  26.53 
 
 		 899 aa  54.7  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  23.53 
 
 		 439 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  33.02 
 
 		 5453 aa  53.9  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  32.24 
 
 		 892 aa  53.9  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  25.34 
 
 		 422 aa  53.5  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  35.51 
 
 		 831 aa  53.5  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  31.51 
 
 		 1628 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  25.66 
 
 		 595 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  27.49 
 
 		 707 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 1121 aa  50.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  24.68 
 
 		 648 aa  50.1  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  32.1 
 
 		 972 aa  49.7  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.06 
 
 		 594 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  25.19 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  26.6 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  24.34 
 
 		 505 aa  47.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  30.26 
 
 		 1242 aa  46.2  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  26.75 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  25.81 
 
 		 483 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  32.93 
 
 		 805 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  33.07 
 
 		 1755 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.65 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.88 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  25.42 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  24.46 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  27.27 
 
 		 2036 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  22.26 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  24.87 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  23.73 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.86 
 
 		 230 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  27.27 
 
 		 1969 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  24.12 
 
 		 457 aa  44.3  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  23.46 
 
 		 451 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  23.11 
 
 		 454 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  23.7 
 
 		 410 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  22.18 
 
 		 443 aa  43.5  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1743  Cna B domain-containing protein  25.38 
 
 		 1384 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729601 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18500  alginate-c5-mannuronan-epimerase AlgG  37.35 
 
 		 543 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0371446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>