118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0669 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  100 
 
 		 570 aa  1124    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.77 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  42.28 
 
 		 352 aa  164  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  34.18 
 
 		 638 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  40.17 
 
 		 409 aa  152  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  35.63 
 
 		 871 aa  133  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  40 
 
 		 302 aa  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  35.11 
 
 		 1200 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  38.38 
 
 		 341 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  34.77 
 
 		 641 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  37.55 
 
 		 500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  44.29 
 
 		 153 aa  107  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  36.5 
 
 		 375 aa  107  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.21 
 
 		 677 aa  106  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  37.21 
 
 		 940 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  28.01 
 
 		 501 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.95 
 
 		 510 aa  94  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  32.82 
 
 		 735 aa  93.6  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  33.33 
 
 		 471 aa  92.8  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  29.41 
 
 		 648 aa  90.1  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  29.84 
 
 		 960 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  36.56 
 
 		 360 aa  88.6  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  27.71 
 
 		 647 aa  87  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  39.33 
 
 		 505 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  41.48 
 
 		 525 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  35.24 
 
 		 1001 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  34.09 
 
 		 810 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  29.48 
 
 		 564 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  32.49 
 
 		 635 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  26.77 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  25.35 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  24.83 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.66 
 
 		 425 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  25.88 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  24.16 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  24.16 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  25.26 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  25.26 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  29.77 
 
 		 1092 aa  70.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  24.17 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  37.91 
 
 		 831 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  27.76 
 
 		 707 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.17 
 
 		 685 aa  66.2  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  30.65 
 
 		 899 aa  65.1  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.96 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  30.61 
 
 		 892 aa  63.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  29.77 
 
 		 1628 aa  63.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  21.4 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  31.93 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  24.7 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  30.74 
 
 		 820 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  22.93 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  31.98 
 
 		 172 aa  61.2  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.3 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  28.81 
 
 		 547 aa  60.8  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.3 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  25.7 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  26.89 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  21.37 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  21.37 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  21.37 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  24.51 
 
 		 445 aa  60.1  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  21.37 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  24.68 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  27.93 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  27.48 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  25.98 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  27.48 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  31 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  29.8 
 
 		 1025 aa  58.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  28.38 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 		 674 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  31.86 
 
 		 805 aa  58.2  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  24.19 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  29.78 
 
 		 1931 aa  57.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  25.41 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 		 1121 aa  57  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  21.96 
 
 		 462 aa  57  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.57 
 
 		 459 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  23.3 
 
 		 439 aa  57  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  23.9 
 
 		 451 aa  57  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  28.06 
 
 		 1242 aa  56.2  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  23.27 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  26.17 
 
 		 418 aa  56.2  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  23.71 
 
 		 410 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  26.13 
 
 		 428 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  25.6 
 
 		 446 aa  54.7  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.17 
 
 		 467 aa  54.3  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  30.18 
 
 		 972 aa  53.9  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  25.51 
 
 		 442 aa  53.5  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  33.55 
 
 		 2272 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  25.71 
 
 		 550 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  26.79 
 
 		 404 aa  53.1  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  24.77 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  26.46 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  22.42 
 
 		 505 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  23.69 
 
 		 425 aa  51.6  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  24.9 
 
 		 431 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  22.71 
 
 		 457 aa  50.4  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 		 1056 aa  50.4  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>