138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2766 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  100 
 
 		 409 aa  801    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  42.68 
 
 		 352 aa  180  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  39.12 
 
 		 570 aa  172  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.28 
 
 		 458 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  38.16 
 
 		 638 aa  143  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  45.34 
 
 		 153 aa  126  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  36.04 
 
 		 302 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  33.74 
 
 		 641 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  36.21 
 
 		 471 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  34.47 
 
 		 500 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  37.11 
 
 		 375 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  32.29 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  34.83 
 
 		 940 aa  106  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.71 
 
 		 677 aa  103  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  35.29 
 
 		 1200 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  35.03 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  35.56 
 
 		 505 aa  100  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  27.09 
 
 		 417 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  30.23 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  29.86 
 
 		 501 aa  96.7  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  38.71 
 
 		 871 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.46 
 
 		 510 aa  96.3  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  29.22 
 
 		 400 aa  94  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  32.13 
 
 		 735 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  28.43 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  28.42 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  28.42 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  28.42 
 
 		 416 aa  87  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  25.33 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  25.33 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  32.79 
 
 		 635 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  32.26 
 
 		 648 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  25.13 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  26.1 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  27.54 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  25.2 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  24.27 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  31.19 
 
 		 308 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  24.27 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  25.68 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  31 
 
 		 899 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  32.01 
 
 		 1001 aa  76.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  27.81 
 
 		 647 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  29.12 
 
 		 960 aa  69.7  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  30.69 
 
 		 892 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.99 
 
 		 685 aa  69.7  0.00000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 1121 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  30.63 
 
 		 831 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  25.8 
 
 		 564 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  29.76 
 
 		 820 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  34.73 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  23.36 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  24.76 
 
 		 674 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.95 
 
 		 467 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  39.62 
 
 		 550 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  23.27 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  23.27 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  23.88 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  22.37 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  26.95 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  25.58 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  37.71 
 
 		 525 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  30.52 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  23.91 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  26.42 
 
 		 454 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  27.17 
 
 		 1931 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  22.74 
 
 		 429 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  24.36 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.96 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.16 
 
 		 425 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  25.07 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.43 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  28.7 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  31.79 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.67 
 
 		 458 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  35.92 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  25.76 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  22.33 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  37.13 
 
 		 805 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.5 
 
 		 467 aa  57.8  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  33.05 
 
 		 810 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  20.38 
 
 		 459 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  30.81 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  33.64 
 
 		 1025 aa  58.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.57 
 
 		 594 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  27.53 
 
 		 863 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.4 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  24.83 
 
 		 452 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  23.03 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  29.23 
 
 		 1056 aa  57  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.86 
 
 		 614 aa  57.4  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  30.98 
 
 		 1755 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  22.95 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  22.56 
 
 		 454 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  23.99 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  25.08 
 
 		 651 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  23.44 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  22.22 
 
 		 638 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  22.45 
 
 		 505 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  36.43 
 
 		 2036 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>