67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0296 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1096    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  42.54 
 
 		 172 aa  82  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  38.85 
 
 		 707 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  29.59 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  38.51 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  57.3 
 
 		 1200 aa  74.7  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  44.44 
 
 		 899 aa  72.8  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  45.92 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  38.76 
 
 		 648 aa  64.7  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.18 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  32.77 
 
 		 638 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  43.75 
 
 		 360 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  34.17 
 
 		 2272 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  38.38 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  39.66 
 
 		 2036 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  37.62 
 
 		 1969 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  36.44 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  35 
 
 		 341 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  38.1 
 
 		 1001 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  37.23 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 464 aa  55.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041673 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  37.1 
 
 		 735 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  35.42 
 
 		 425 aa  55.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  38.46 
 
 		 400 aa  54.7  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  34.03 
 
 		 635 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  25.71 
 
 		 570 aa  53.5  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  37.36 
 
 		 400 aa  53.5  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  31.78 
 
 		 153 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  33.66 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.69 
 
 		 1143 aa  53.5  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  28.33 
 
 		 375 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  33.66 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  36.51 
 
 		 302 aa  52.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  32.39 
 
 		 844 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  39.71 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  40 
 
 		 428 aa  52  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  39.42 
 
 		 1750 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  31.25 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  31.25 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1743  Cna B domain-containing protein  46.05 
 
 		 1384 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729601 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  38.36 
 
 		 416 aa  50.4  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  38.36 
 
 		 416 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  38.36 
 
 		 416 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  34.15 
 
 		 1092 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  32.29 
 
 		 423 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.03 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  31.2 
 
 		 871 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  36 
 
 		 1732 aa  47.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  36.11 
 
 		 547 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  31.69 
 
 		 417 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.36 
 
 		 458 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  32.14 
 
 		 907 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  32.5 
 
 		 671 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  32.47 
 
 		 525 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  31.18 
 
 		 810 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  35.8 
 
 		 509 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  31.08 
 
 		 911 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  31.08 
 
 		 911 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  31.43 
 
 		 911 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  35.14 
 
 		 651 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  32.86 
 
 		 410 aa  45.1  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  27.41 
 
 		 960 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4700  hypothetical protein  47.27 
 
 		 2698 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  28.3 
 
 		 459 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  25.9 
 
 		 454 aa  44.3  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.5 
 
 		 459 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  28.16 
 
 		 483 aa  43.5  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>