31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4700 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2297  putative signal peptide protein  72.47 
 
 		 2742 aa  3878    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.992598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4700  hypothetical protein  100 
 
 		 2698 aa  5472    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  34.3 
 
 		 4978 aa  89.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  35.53 
 
 		 5745 aa  81.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  38.22 
 
 		 1416 aa  77  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  36.49 
 
 		 2816 aa  76.3  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2349  hypothetical protein  40 
 
 		 974 aa  68.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  36.14 
 
 		 721 aa  68.6  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  38.07 
 
 		 1268 aa  65.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  32.11 
 
 		 1512 aa  63.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.47 
 
 		 3816 aa  62.8  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  37.71 
 
 		 1269 aa  62  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 3191 aa  60.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2298  putative signal peptide protein  27 
 
 		 532 aa  56.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288509  normal  0.262712 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  36.57 
 
 		 1269 aa  56.6  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  31.16 
 
 		 3474 aa  55.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.79 
 
 		 1884 aa  53.1  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3162  multicopper oxidase type 3  23.97 
 
 		 371 aa  53.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  30.17 
 
 		 1597 aa  52.8  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.07 
 
 		 2807 aa  52.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  25.98 
 
 		 1706 aa  52  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.93 
 
 		 2114 aa  50.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  32.91 
 
 		 1712 aa  49.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4701  multicopper oxidase type 3  26.15 
 
 		 531 aa  49.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0213399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.99 
 
 		 1433 aa  49.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.51 
 
 		 1215 aa  48.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.52 
 
 		 369 aa  48.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  32.51 
 
 		 1215 aa  48.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.3 
 
 		 1066 aa  48.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  30.58 
 
 		 4848 aa  46.6  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2565  hypothetical protein  33.04 
 
 		 464 aa  46.2  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041673 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>