46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2930 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  77.64 
 
 
883 aa  1401    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  77.45 
 
 
882 aa  1364    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  92.32 
 
 
911 aa  1665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  100 
 
 
907 aa  1873    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  73.98 
 
 
880 aa  1345    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  76.28 
 
 
884 aa  1405    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  92.43 
 
 
911 aa  1662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  92.21 
 
 
911 aa  1663    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  47.8 
 
 
395 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  47.38 
 
 
394 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  46.56 
 
 
394 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  43.19 
 
 
393 aa  322  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  46.76 
 
 
394 aa  319  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  45.92 
 
 
390 aa  317  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  44.32 
 
 
411 aa  312  2e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  42.05 
 
 
396 aa  281  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  42.65 
 
 
366 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  44.61 
 
 
374 aa  267  5e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  42.06 
 
 
367 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  42.35 
 
 
367 aa  265  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  41.5 
 
 
368 aa  257  8e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  42.73 
 
 
345 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  38.57 
 
 
343 aa  233  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  40.62 
 
 
402 aa  232  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  37.43 
 
 
413 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  37.43 
 
 
413 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.19 
 
 
413 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  39.17 
 
 
411 aa  219  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  37.83 
 
 
415 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  39.43 
 
 
400 aa  209  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  34.87 
 
 
383 aa  201  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1644  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.93 
 
 
423 aa  168  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.202542  normal  0.498245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  35.37 
 
 
768 aa  152  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  28.53 
 
 
509 aa  105  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  26.33 
 
 
386 aa  98.6  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  28.4 
 
 
359 aa  96.3  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  24.25 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  24.25 
 
 
366 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  24.25 
 
 
366 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  26.19 
 
 
2172 aa  78.6  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  26.35 
 
 
427 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5589  hypothetical protein  27.16 
 
 
491 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  22.3 
 
 
453 aa  48.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  30.19 
 
 
981 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.32 
 
 
425 aa  46.6  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  32.14 
 
 
550 aa  45.8  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>