32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2901 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  818    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  63.68 
 
 		 395 aa  519  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  63.4 
 
 		 390 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  61.32 
 
 		 411 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  60.61 
 
 		 394 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  60.61 
 
 		 394 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  60.61 
 
 		 394 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  54.59 
 
 		 396 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  46.09 
 
 		 911 aa  330  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  46.09 
 
 		 911 aa  329  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  46.93 
 
 		 882 aa  329  6e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  45.81 
 
 		 911 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  44.48 
 
 		 907 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  44.1 
 
 		 884 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  44.94 
 
 		 883 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  45.28 
 
 		 880 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  38 
 
 		 343 aa  212  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  36.18 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  36.21 
 
 		 366 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  36.84 
 
 		 374 aa  195  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  35.86 
 
 		 367 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  34.97 
 
 		 345 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  35.31 
 
 		 368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  31.57 
 
 		 383 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  26.32 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  29.49 
 
 		 2172 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  26.11 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  25.29 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  26.04 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  26.39 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  28.33 
 
 		 917 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  27.12 
 
 		 924 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>