33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1377 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  696    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  45.99 
 
 		 345 aa  278  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  38.57 
 
 		 907 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  37.74 
 
 		 911 aa  228  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  37.74 
 
 		 911 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  37.74 
 
 		 911 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  40.72 
 
 		 882 aa  226  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  41.75 
 
 		 366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  39.23 
 
 		 368 aa  225  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  39.81 
 
 		 884 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  41.61 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  41.95 
 
 		 367 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  40.13 
 
 		 883 aa  222  8e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  38.61 
 
 		 880 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  38 
 
 		 393 aa  212  9e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  38.75 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  38.99 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  35.6 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  35.6 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  35.93 
 
 		 390 aa  195  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  35.29 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  37.61 
 
 		 411 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  38.32 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  31.76 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  27.47 
 
 		 359 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  30.56 
 
 		 386 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  30.77 
 
 		 2172 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  30.07 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  30.3 
 
 		 366 aa  79.7  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  28.43 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  30.17 
 
 		 765 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  32.04 
 
 		 1046 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  38.38 
 
 		 1171 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>