31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1980 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  767    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  50.55 
 
 
368 aa  339  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  44.25 
 
 
345 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  43.1 
 
 
367 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  44.97 
 
 
367 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  44.61 
 
 
907 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  43.38 
 
 
366 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  44.01 
 
 
911 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  44.31 
 
 
911 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  44.01 
 
 
911 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  43.02 
 
 
882 aa  262  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  42.64 
 
 
883 aa  252  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  41.14 
 
 
884 aa  249  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  43.71 
 
 
880 aa  246  6e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  39.56 
 
 
395 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  38.56 
 
 
390 aa  205  9e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  36.76 
 
 
343 aa  205  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  38.63 
 
 
394 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  38.63 
 
 
394 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  38.32 
 
 
394 aa  199  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  35.96 
 
 
383 aa  197  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  37.07 
 
 
393 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  37.46 
 
 
396 aa  188  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  37.54 
 
 
411 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  28.16 
 
 
2172 aa  89.7  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  26.97 
 
 
359 aa  82.8  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  26.51 
 
 
386 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  25.9 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  25.08 
 
 
366 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  25.42 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  32.35 
 
 
765 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>