30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_00205 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  100 
 
 
383 aa  798    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  37.19 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  35.63 
 
 
911 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  34.87 
 
 
907 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  35.06 
 
 
911 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  35.06 
 
 
911 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  35.96 
 
 
374 aa  196  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  32.56 
 
 
368 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  33.53 
 
 
884 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  35.21 
 
 
883 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  35.4 
 
 
880 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  33.04 
 
 
882 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  32.43 
 
 
366 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  31.53 
 
 
367 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  31.76 
 
 
343 aa  179  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  34.94 
 
 
394 aa  179  8e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  34.94 
 
 
394 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  35.06 
 
 
390 aa  178  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  30.89 
 
 
367 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  34.09 
 
 
394 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  33.42 
 
 
396 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  32.52 
 
 
395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  33.54 
 
 
393 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  31.21 
 
 
411 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  28.57 
 
 
2172 aa  106  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  27.89 
 
 
386 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  25 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  24.32 
 
 
366 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  24.32 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  24.51 
 
 
359 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>