34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3273 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  716    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  49.67 
 
 		 367 aa  300  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  49.01 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  45.9 
 
 		 366 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  46.27 
 
 		 368 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  45.99 
 
 		 343 aa  278  7e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  43.68 
 
 		 374 aa  278  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  43.62 
 
 		 882 aa  263  3e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  42.73 
 
 		 907 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  42.77 
 
 		 911 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  42.48 
 
 		 911 aa  256  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  42.48 
 
 		 911 aa  256  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  43.03 
 
 		 883 aa  250  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  41.27 
 
 		 884 aa  249  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  40.42 
 
 		 880 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  40.37 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  36.75 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  39.2 
 
 		 390 aa  209  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  39.2 
 
 		 394 aa  205  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  38.58 
 
 		 394 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  38.58 
 
 		 394 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  36.34 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  34.81 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  38.46 
 
 		 396 aa  185  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  30.3 
 
 		 366 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  30.61 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  30.51 
 
 		 366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  29.55 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  30.42 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  28.88 
 
 		 2172 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  31.78 
 
 		 765 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  32.14 
 
 		 776 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  34.29 
 
 		 1046 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  31.13 
 
 		 1063 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>