57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2950 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
1046 aa  2157    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  38.33 
 
 
1067 aa  655    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  40.04 
 
 
1068 aa  736    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  48.76 
 
 
1063 aa  408  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  49.5 
 
 
1182 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  47.24 
 
 
1074 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  48.15 
 
 
1066 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  45.05 
 
 
1091 aa  371  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  45.91 
 
 
1074 aa  370  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  46.63 
 
 
1171 aa  356  1e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  48.39 
 
 
1013 aa  352  2e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  42.12 
 
 
776 aa  345  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  41.13 
 
 
772 aa  343  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  44.57 
 
 
765 aa  333  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  49.33 
 
 
924 aa  328  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  39.31 
 
 
922 aa  310  6.999999999999999e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  40.68 
 
 
888 aa  300  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  37.09 
 
 
917 aa  299  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  38.94 
 
 
911 aa  281  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  39.94 
 
 
963 aa  249  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  35.61 
 
 
883 aa  234  5e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  38.48 
 
 
1097 aa  228  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  39.39 
 
 
1129 aa  228  5.0000000000000005e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  35.64 
 
 
922 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  50.44 
 
 
792 aa  220  1e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  33.99 
 
 
984 aa  216  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  45.11 
 
 
782 aa  204  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  32.88 
 
 
805 aa  201  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  28.38 
 
 
785 aa  134  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  28.37 
 
 
841 aa  127  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  29.23 
 
 
768 aa  124  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3052  hypothetical protein  47.41 
 
 
1660 aa  104  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000632235 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  28.05 
 
 
725 aa  93.6  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  29.47 
 
 
1737 aa  87  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  27.03 
 
 
759 aa  84.3  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  26.25 
 
 
565 aa  79.3  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  24.88 
 
 
893 aa  74.7  0.000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  26.52 
 
 
998 aa  74.3  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  25.48 
 
 
833 aa  73.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  33.93 
 
 
131 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  26.79 
 
 
626 aa  68.2  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  33.63 
 
 
147 aa  67.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  29.78 
 
 
1178 aa  65.1  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  32.73 
 
 
468 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  30.56 
 
 
646 aa  62  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  26.04 
 
 
562 aa  61.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  36.17 
 
 
503 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  33.64 
 
 
136 aa  56.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  28.79 
 
 
507 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  30.3 
 
 
132 aa  53.9  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  28.57 
 
 
724 aa  53.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  30.17 
 
 
729 aa  52.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  30.84 
 
 
132 aa  51.6  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  34.29 
 
 
345 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  26.02 
 
 
716 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  32.04 
 
 
343 aa  44.7  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  25.32 
 
 
756 aa  44.7  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>