59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0959 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
776 aa  1612    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  77.75 
 
 
772 aa  1281    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  61.4 
 
 
765 aa  989    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  53.56 
 
 
1066 aa  465  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  58.93 
 
 
1068 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  50.86 
 
 
1182 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  54.42 
 
 
1074 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  47.63 
 
 
1091 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  50.4 
 
 
1074 aa  395  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  47.04 
 
 
1063 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  41.63 
 
 
1046 aa  344  4e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  46.13 
 
 
1067 aa  332  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  45.88 
 
 
1013 aa  323  7e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  46.97 
 
 
1171 aa  322  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  44.73 
 
 
924 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  46.9 
 
 
888 aa  299  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  42.35 
 
 
911 aa  298  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  43.94 
 
 
917 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  40.06 
 
 
922 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  37.17 
 
 
963 aa  233  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  37.57 
 
 
792 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  34.61 
 
 
1097 aa  212  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  33.16 
 
 
922 aa  207  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 
883 aa  199  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 
1129 aa  196  9e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  43.44 
 
 
782 aa  196  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  30.92 
 
 
805 aa  177  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  31.25 
 
 
984 aa  177  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  27.34 
 
 
785 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  27.06 
 
 
768 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  24.87 
 
 
1737 aa  123  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  23.64 
 
 
759 aa  112  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  23.7 
 
 
998 aa  107  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  24.49 
 
 
893 aa  107  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  24.41 
 
 
833 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  21.98 
 
 
725 aa  102  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  21.21 
 
 
1178 aa  95.9  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  25.26 
 
 
565 aa  95.9  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  26.43 
 
 
841 aa  83.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  23.61 
 
 
626 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  35.14 
 
 
724 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  34.26 
 
 
468 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  37.25 
 
 
646 aa  60.8  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  35.19 
 
 
132 aa  59.3  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  30.63 
 
 
507 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  22.69 
 
 
562 aa  58.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  28.83 
 
 
147 aa  58.2  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  31.48 
 
 
729 aa  55.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  36.54 
 
 
129 aa  55.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  29.63 
 
 
503 aa  54.3  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  33.64 
 
 
131 aa  54.3  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  34.38 
 
 
465 aa  53.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  29.63 
 
 
136 aa  51.2  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0161  hypothetical protein  35.19 
 
 
171 aa  50.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  31.06 
 
 
756 aa  50.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  32.14 
 
 
345 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  23.33 
 
 
716 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  36 
 
 
368 aa  44.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0603  UDP-N-acetylmuramate dehydrogenase  26.86 
 
 
393 aa  44.3  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>