45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2900 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  74.26 
 
 
911 aa  1340    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  100 
 
 
880 aa  1808    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  81.09 
 
 
884 aa  1486    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  73.64 
 
 
907 aa  1318    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  74.49 
 
 
882 aa  1321    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  83.47 
 
 
883 aa  1486    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  73.46 
 
 
911 aa  1328    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  73.8 
 
 
911 aa  1332    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  44.72 
 
 
395 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  43.93 
 
 
393 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  43.49 
 
 
390 aa  302  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  43.65 
 
 
394 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  43.09 
 
 
394 aa  297  7e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  44.6 
 
 
411 aa  297  7e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  42.82 
 
 
394 aa  295  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  41.6 
 
 
396 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  44.65 
 
 
368 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  43.71 
 
 
374 aa  246  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  39.41 
 
 
366 aa  241  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  39.12 
 
 
367 aa  237  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  40.42 
 
 
345 aa  234  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  38.53 
 
 
367 aa  232  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  38.78 
 
 
402 aa  230  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.28 
 
 
411 aa  222  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  36.8 
 
 
415 aa  213  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  38.89 
 
 
343 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  35.58 
 
 
413 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  36.19 
 
 
413 aa  210  9e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.32 
 
 
413 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  39.43 
 
 
400 aa  206  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  35.4 
 
 
383 aa  188  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1644  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.16 
 
 
423 aa  164  9e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.202542  normal  0.498245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  36.08 
 
 
768 aa  161  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  31.36 
 
 
509 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  26.69 
 
 
359 aa  88.2  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  26.25 
 
 
386 aa  81.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  25.36 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  26.06 
 
 
366 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  26.06 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  28.22 
 
 
2172 aa  73.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  26.87 
 
 
427 aa  62.4  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  21.94 
 
 
453 aa  50.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2594  hypothetical protein  22.47 
 
 
683 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.397172 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5589  hypothetical protein  29.25 
 
 
491 aa  45.4  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.78 
 
 
425 aa  44.3  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>