58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0517 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  39.35 
 
 		 1066 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  36.31 
 
 		 1074 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  39.62 
 
 		 1068 aa  733    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 		 1063 aa  2185    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  38.8 
 
 		 1091 aa  711    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  35.88 
 
 		 1067 aa  607  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  48.76 
 
 		 1046 aa  402  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  47.04 
 
 		 776 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  52 
 
 		 765 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  47.53 
 
 		 1182 aa  373  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  44.66 
 
 		 1074 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  51.03 
 
 		 772 aa  370  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  46.18 
 
 		 1013 aa  337  5e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  44.6 
 
 		 1171 aa  328  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  47.03 
 
 		 922 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  46.18 
 
 		 917 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  41.88 
 
 		 924 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  43.1 
 
 		 888 aa  295  5e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  41.36 
 
 		 911 aa  293  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  36.04 
 
 		 1097 aa  222  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  37.73 
 
 		 1129 aa  221  6e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  36.21 
 
 		 963 aa  221  7.999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  35.46 
 
 		 922 aa  220  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  29.82 
 
 		 805 aa  218  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  32.71 
 
 		 883 aa  210  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  35.47 
 
 		 792 aa  209  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  43.8 
 
 		 782 aa  207  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  32.15 
 
 		 984 aa  204  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  27.7 
 
 		 785 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  27.32 
 
 		 841 aa  111  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  27.09 
 
 		 768 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  28.69 
 
 		 998 aa  95.5  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  30.56 
 
 		 759 aa  89.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  27.52 
 
 		 1737 aa  82  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  26.53 
 
 		 833 aa  81.3  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  25.37 
 
 		 1178 aa  74.3  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  28.3 
 
 		 725 aa  72.8  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  28.64 
 
 		 565 aa  72  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  24.5 
 
 		 893 aa  70.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  33.59 
 
 		 131 aa  65.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  31.5 
 
 		 147 aa  64.3  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  34.21 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  29.29 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  22.17 
 
 		 626 aa  60.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  39.58 
 
 		 503 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  28.34 
 
 		 562 aa  57.8  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  29.09 
 
 		 724 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  29.57 
 
 		 729 aa  55.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  33.96 
 
 		 136 aa  54.3  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  33.03 
 
 		 129 aa  53.5  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  32.73 
 
 		 132 aa  53.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  31.13 
 
 		 132 aa  51.6  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  25.2 
 
 		 716 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  31.31 
 
 		 756 aa  49.3  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  30.69 
 
 		 507 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0161  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  47.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  32.98 
 
 		 465 aa  47.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1252  hypothetical protein  33.71 
 
 		 129 aa  44.7  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>