30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3162 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  706    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  97.81 
 
 
366 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  93.99 
 
 
366 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  65.05 
 
 
386 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  37.54 
 
 
359 aa  170  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  30.93 
 
 
345 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  25.28 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  25.28 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  26.84 
 
 
884 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  25.42 
 
 
390 aa  94  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  24.72 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  24.11 
 
 
911 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  24.11 
 
 
911 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  24.7 
 
 
911 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  30.03 
 
 
343 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  24.4 
 
 
907 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  28.57 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  26.35 
 
 
882 aa  84  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  30.03 
 
 
367 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  25.29 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  25.3 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  30.26 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  28.7 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  26.06 
 
 
880 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  24.78 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  27.39 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  26.67 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  25.88 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  23.91 
 
 
883 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  26.16 
 
 
2172 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>