30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2405 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  100 
 
 		 411 aa  847    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  61.46 
 
 		 393 aa  494  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  61.16 
 
 		 390 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  57.18 
 
 		 395 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  58.14 
 
 		 394 aa  463  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  57.61 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  55.56 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  57.25 
 
 		 396 aa  444  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  45.88 
 
 		 884 aa  318  9e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  44.59 
 
 		 911 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  44.59 
 
 		 911 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  44.59 
 
 		 911 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  44.32 
 
 		 907 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  46.61 
 
 		 882 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  45.68 
 
 		 883 aa  308  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  44.6 
 
 		 880 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  37.31 
 
 		 367 aa  203  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  37.31 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  36.7 
 
 		 366 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  38.08 
 
 		 345 aa  195  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  37.61 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  37.54 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  38.75 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  29.25 
 
 		 383 aa  162  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  27.88 
 
 		 386 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  30.08 
 
 		 2172 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  26.75 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  27.39 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  27.39 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  27.07 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>