31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2931 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  806    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  83.97 
 
 		 394 aa  681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  84.26 
 
 		 394 aa  683    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  82.7 
 
 		 394 aa  669    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  61.01 
 
 		 393 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  58.84 
 
 		 395 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  58.84 
 
 		 411 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  53.89 
 
 		 396 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  47.61 
 
 		 882 aa  326  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  46.48 
 
 		 911 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  46.48 
 
 		 911 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  46.2 
 
 		 911 aa  318  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  45.92 
 
 		 907 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  43.94 
 
 		 884 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  44.23 
 
 		 883 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  43.49 
 
 		 880 aa  302  7.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  39.2 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  38.56 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  36.84 
 
 		 367 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  37.15 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  36.84 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  35.63 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  35.07 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  32.75 
 
 		 383 aa  180  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  26.87 
 
 		 359 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  25 
 
 		 366 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  25.74 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  25.74 
 
 		 366 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  25.29 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  29.46 
 
 		 2172 aa  86.7  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  30.91 
 
 		 924 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>