47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1658 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  81.09 
 
 
880 aa  1471    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  75.48 
 
 
907 aa  1362    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  100 
 
 
884 aa  1820    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  76.25 
 
 
911 aa  1380    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  76.48 
 
 
911 aa  1383    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  79.64 
 
 
883 aa  1436    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  74.89 
 
 
882 aa  1348    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  76.36 
 
 
911 aa  1383    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  44.22 
 
 
411 aa  320  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  45.63 
 
 
395 aa  318  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  42.56 
 
 
393 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  45.35 
 
 
394 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  45.07 
 
 
394 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  43.66 
 
 
390 aa  308  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  44.79 
 
 
394 aa  307  6e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  41.64 
 
 
396 aa  270  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  43.37 
 
 
368 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  41.34 
 
 
367 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  39.71 
 
 
366 aa  256  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  41.34 
 
 
367 aa  253  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  41.74 
 
 
374 aa  249  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  41.84 
 
 
345 aa  248  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  41.71 
 
 
402 aa  227  7e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  39.81 
 
 
343 aa  223  9e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.79 
 
 
411 aa  218  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  37.28 
 
 
415 aa  210  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  36.84 
 
 
413 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  36.84 
 
 
413 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.55 
 
 
413 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  39.09 
 
 
400 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  33.53 
 
 
383 aa  192  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1644  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.05 
 
 
423 aa  164  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.202542  normal  0.498245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  34.78 
 
 
768 aa  151  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  30.15 
 
 
509 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  26.55 
 
 
359 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  27.56 
 
 
386 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  26.72 
 
 
366 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  26.2 
 
 
2172 aa  90.9  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  26.16 
 
 
366 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  25.94 
 
 
366 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  25.99 
 
 
427 aa  57.4  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  21.66 
 
 
453 aa  52  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  31.68 
 
 
765 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29690  hypothetical protein  21.38 
 
 
348 aa  46.2  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388142  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.89 
 
 
425 aa  45.8  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  23.55 
 
 
638 aa  45.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2594  hypothetical protein  23.48 
 
 
683 aa  44.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.397172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>