47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1474 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  78.22 
 
 
883 aa  1415    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  77.41 
 
 
882 aa  1375    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  98.79 
 
 
911 aa  1868    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  91.88 
 
 
907 aa  1656    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  73.72 
 
 
880 aa  1343    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  76.39 
 
 
884 aa  1412    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  99.45 
 
 
911 aa  1875    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  100 
 
 
911 aa  1883    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1657  hypothetical protein  49.01 
 
 
395 aa  341  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.646777  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1538  hypothetical protein  48.73 
 
 
394 aa  330  7e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0374559  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2901  hypothetical protein  44.68 
 
 
393 aa  330  9e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00324052  normal  0.0158775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1532  hypothetical protein  48.17 
 
 
394 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.159244  unclonable  0.000000000103674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1473  hypothetical protein  47.89 
 
 
394 aa  324  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00637009  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2931  hypothetical protein  46.48 
 
 
390 aa  322  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2405  hypothetical protein  44.59 
 
 
411 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.774074  normal  0.803755 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2117  hypothetical protein  43.47 
 
 
396 aa  291  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  41.76 
 
 
366 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  41.18 
 
 
367 aa  266  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1980  hypothetical protein  44.31 
 
 
374 aa  265  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.78272  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  41.47 
 
 
367 aa  265  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0654  hypothetical protein  42.6 
 
 
368 aa  258  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000736898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  42.48 
 
 
345 aa  256  2.0000000000000002e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  39.94 
 
 
402 aa  230  8e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  37.74 
 
 
343 aa  226  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  37.34 
 
 
413 aa  221  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  37.34 
 
 
413 aa  220  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.11 
 
 
413 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  38.42 
 
 
415 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.28 
 
 
411 aa  216  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  39.43 
 
 
400 aa  208  4e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00205  hypothetical protein  35.06 
 
 
383 aa  200  1.0000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1644  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.94 
 
 
423 aa  170  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.202542  normal  0.498245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  34.47 
 
 
768 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2914  hypothetical protein  27.65 
 
 
386 aa  105  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.292842  normal  0.0819402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  27.61 
 
 
509 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3850  hypothetical protein  28.75 
 
 
359 aa  99  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0639053  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3162  hypothetical protein  23.81 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2966  hypothetical protein  23.81 
 
 
366 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0581802  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3054  hypothetical protein  23.81 
 
 
366 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.837847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  28.4 
 
 
2172 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  26.35 
 
 
427 aa  54.7  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  31.67 
 
 
981 aa  51.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  24.52 
 
 
453 aa  48.5  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29690  hypothetical protein  23.1 
 
 
348 aa  48.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388142  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5589  hypothetical protein  28.47 
 
 
491 aa  47  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.32 
 
 
425 aa  46.2  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  31.08 
 
 
550 aa  45.4  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>