67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1595 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  63.6 
 
 
776 aa  988    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  61.65 
 
 
772 aa  991    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
765 aa  1598    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  57.3 
 
 
1068 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  48.94 
 
 
1182 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  52.85 
 
 
1066 aa  408  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  52.04 
 
 
1074 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  49.59 
 
 
1091 aa  398  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  52 
 
 
1063 aa  384  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  47.78 
 
 
1074 aa  364  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  45.71 
 
 
1067 aa  332  2e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  44.57 
 
 
1046 aa  330  4e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  45.06 
 
 
1013 aa  316  9e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  46.24 
 
 
1171 aa  303  6.000000000000001e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  44.26 
 
 
888 aa  296  1e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  39.94 
 
 
911 aa  290  6e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  41.64 
 
 
924 aa  287  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  40.96 
 
 
917 aa  280  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  39.89 
 
 
922 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  37.57 
 
 
963 aa  224  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  34.82 
 
 
1097 aa  213  1e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  34.54 
 
 
922 aa  210  6e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  40.71 
 
 
792 aa  211  6e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  34.78 
 
 
883 aa  207  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  34.16 
 
 
1129 aa  202  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  31.75 
 
 
805 aa  202  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  36.45 
 
 
782 aa  197  9e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  30.52 
 
 
984 aa  177  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  25.07 
 
 
768 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  25.29 
 
 
1737 aa  131  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  26.11 
 
 
998 aa  127  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  24.44 
 
 
1178 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  27.29 
 
 
785 aa  120  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  26.02 
 
 
841 aa  117  6e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  27.11 
 
 
833 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  25 
 
 
565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  22.41 
 
 
759 aa  110  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  22.31 
 
 
893 aa  98.6  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  20.59 
 
 
626 aa  91.3  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  25.1 
 
 
725 aa  76.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  35.92 
 
 
646 aa  63.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  37.29 
 
 
131 aa  60.8  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  35.14 
 
 
132 aa  58.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  31.25 
 
 
651 aa  57.4  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  35.24 
 
 
468 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  35.45 
 
 
147 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  22.01 
 
 
562 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  36.28 
 
 
503 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  31.53 
 
 
132 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3273  hypothetical protein  31.78 
 
 
345 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  32.38 
 
 
724 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  32.29 
 
 
465 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  34.29 
 
 
507 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  35.24 
 
 
251 aa  50.1  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  31.68 
 
 
884 aa  49.3  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1624  hypothetical protein  30.36 
 
 
646 aa  48.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2707  hypothetical protein  31.3 
 
 
367 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  29.36 
 
 
136 aa  47.8  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1377  hypothetical protein  30.17 
 
 
343 aa  47  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0161  hypothetical protein  35.71 
 
 
171 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2802  hypothetical protein  30.43 
 
 
367 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5046  hypothetical protein  30 
 
 
189 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.401847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  31.68 
 
 
756 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2621  hypothetical protein  30.77 
 
 
366 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.928291  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  29.7 
 
 
911 aa  44.3  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  29.7 
 
 
911 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  29.7 
 
 
911 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>