50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3693 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  271  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  62.83 
 
 
136 aa  156  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  53.79 
 
 
132 aa  155  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  54.87 
 
 
131 aa  136  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  41.67 
 
 
129 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  37.14 
 
 
646 aa  72.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  34.29 
 
 
841 aa  66.6  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  37.76 
 
 
465 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  33.94 
 
 
756 aa  63.5  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  33.94 
 
 
772 aa  62  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  33.01 
 
 
507 aa  60.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  35.64 
 
 
299 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  35.19 
 
 
776 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  28.57 
 
 
503 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  35.14 
 
 
765 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  25.76 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  34.29 
 
 
729 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  30.19 
 
 
468 aa  57.4  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  32.74 
 
 
1737 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  30.1 
 
 
147 aa  56.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  34.95 
 
 
251 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  29.52 
 
 
724 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  31.07 
 
 
922 aa  53.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  32.35 
 
 
1097 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  30.19 
 
 
1013 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  32.73 
 
 
1063 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  30.1 
 
 
883 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  33 
 
 
768 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  28 
 
 
785 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  30.84 
 
 
1046 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6394  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  26.98 
 
 
911 aa  50.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  30.1 
 
 
1129 aa  49.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  27.62 
 
 
651 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  32.69 
 
 
963 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  33.33 
 
 
1074 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3541  hypothetical protein  29.41 
 
 
137 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  26.45 
 
 
924 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  28.44 
 
 
1091 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  28.16 
 
 
805 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  29.6 
 
 
1171 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5046  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.401847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  29.52 
 
 
984 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  24.55 
 
 
716 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  27.78 
 
 
917 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0161  hypothetical protein  29.91 
 
 
171 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  28.32 
 
 
1066 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2990  cytochrome c family protein, putative  22.31 
 
 
157 aa  41.6  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  25 
 
 
922 aa  40.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  28.21 
 
 
1182 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>