60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1040 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  68.27 
 
 		 785 aa  1120    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 		 768 aa  1583    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  43.77 
 
 		 841 aa  422  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  29.17 
 
 		 759 aa  194  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  27.74 
 
 		 833 aa  171  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  30.42 
 
 		 1129 aa  150  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  36.54 
 
 		 468 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  25.9 
 
 		 1737 aa  145  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  28.83 
 
 		 805 aa  140  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  31.15 
 
 		 724 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  36.23 
 
 		 507 aa  135  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  23.89 
 
 		 772 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  25.07 
 
 		 765 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  28.95 
 
 		 984 aa  133  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  27.06 
 
 		 776 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  32.11 
 
 		 729 aa  131  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  28.3 
 
 		 1097 aa  130  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  28.81 
 
 		 922 aa  128  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  26.18 
 
 		 626 aa  127  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  23.19 
 
 		 893 aa  127  8.000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  25.87 
 
 		 562 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  29.23 
 
 		 1046 aa  124  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  32.58 
 
 		 503 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  32.69 
 
 		 465 aa  122  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  29.24 
 
 		 1013 aa  121  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  25.07 
 
 		 1178 aa  120  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  28.08 
 
 		 922 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  32.38 
 
 		 716 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  25 
 
 		 565 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  28.69 
 
 		 1182 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  23.97 
 
 		 883 aa  114  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  30.86 
 
 		 1068 aa  114  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  27.6 
 
 		 963 aa  113  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  26.76 
 
 		 924 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  28.49 
 
 		 917 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  26.82 
 
 		 911 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  27.09 
 
 		 1063 aa  108  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  29.94 
 
 		 1091 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1074 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  27.46 
 
 		 1066 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  29.6 
 
 		 1171 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  24.86 
 
 		 998 aa  98.6  4e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  31.22 
 
 		 792 aa  97.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  27.46 
 
 		 725 aa  95.1  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  26.55 
 
 		 1074 aa  84.3  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  29.9 
 
 		 782 aa  75.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  24.71 
 
 		 1067 aa  73.9  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  33.7 
 
 		 147 aa  67.4  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  36.46 
 
 		 124 aa  66.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  31.69 
 
 		 646 aa  66.6  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  29.71 
 
 		 756 aa  65.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  27.49 
 
 		 888 aa  64.3  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  30.83 
 
 		 651 aa  60.1  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  36 
 
 		 136 aa  55.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  31.82 
 
 		 251 aa  54.7  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  33 
 
 		 132 aa  52.4  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  30.84 
 
 		 129 aa  52  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  35.56 
 
 		 299 aa  50.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  31.31 
 
 		 131 aa  49.3  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  29.63 
 
 		 132 aa  49.3  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>