57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1978 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  80.27 
 
 		 776 aa  1273    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 		 772 aa  1606    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  61.65 
 
 		 765 aa  991    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  55.06 
 
 		 1066 aa  452  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  48.9 
 
 		 1091 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  53.49 
 
 		 1074 aa  425  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  49.05 
 
 		 1182 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  54.75 
 
 		 1068 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  54.94 
 
 		 1074 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  51.03 
 
 		 1063 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  40.64 
 
 		 1046 aa  342  2e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  44.53 
 
 		 1067 aa  340  8e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  49.85 
 
 		 1171 aa  336  9e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  47.18 
 
 		 1013 aa  321  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  43.63 
 
 		 924 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  46.43 
 
 		 888 aa  300  7e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  42.32 
 
 		 911 aa  292  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  41.57 
 
 		 917 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  40.05 
 
 		 922 aa  277  7e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  35.6 
 
 		 963 aa  228  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  36.69 
 
 		 1097 aa  220  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  34.11 
 
 		 922 aa  219  2e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  47.06 
 
 		 792 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  45.08 
 
 		 782 aa  204  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  33.33 
 
 		 883 aa  198  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  34.42 
 
 		 1129 aa  197  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  32.18 
 
 		 984 aa  193  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  29.26 
 
 		 805 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  27.76 
 
 		 785 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  23.89 
 
 		 768 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  27.47 
 
 		 841 aa  128  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  24.21 
 
 		 1737 aa  124  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  23.92 
 
 		 759 aa  119  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  24.13 
 
 		 833 aa  113  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  21.37 
 
 		 725 aa  104  7e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  21.92 
 
 		 1178 aa  102  3e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  23.98 
 
 		 893 aa  100  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  23.77 
 
 		 998 aa  99  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  24.11 
 
 		 565 aa  94.4  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  22.96 
 
 		 626 aa  90.1  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  36.11 
 
 		 724 aa  74.3  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  41.67 
 
 		 646 aa  68.6  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  33.94 
 
 		 132 aa  62  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  34.26 
 
 		 507 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  30.33 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  35.19 
 
 		 131 aa  58.9  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  35.24 
 
 		 129 aa  58.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  23.2 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  34.02 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  29.13 
 
 		 147 aa  57.4  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  32.38 
 
 		 729 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  29.09 
 
 		 503 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5679  hypothetical protein  28.46 
 
 		 137 aa  50.8  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.714898  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  30.53 
 
 		 756 aa  50.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  28.44 
 
 		 136 aa  46.6  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1889  fatty acid cistrans isomerase  36.76 
 
 		 766 aa  45.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.521979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  25 
 
 		 716 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>