57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3229 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 		 1171 aa  2413    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  42.86 
 
 		 917 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  41.7 
 
 		 1013 aa  360  6e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  46.9 
 
 		 1074 aa  360  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  40.6 
 
 		 922 aa  355  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  49.42 
 
 		 1046 aa  354  5.9999999999999994e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  47.91 
 
 		 924 aa  352  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  45.18 
 
 		 1068 aa  343  9e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  46.23 
 
 		 1066 aa  340  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  49.85 
 
 		 772 aa  336  1e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  44.6 
 
 		 1063 aa  328  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1074 aa  323  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  46.97 
 
 		 776 aa  322  1.9999999999999998e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  42.42 
 
 		 1182 aa  319  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  46.01 
 
 		 1091 aa  319  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  43.04 
 
 		 911 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  46.24 
 
 		 765 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  44.93 
 
 		 1067 aa  293  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  40.66 
 
 		 888 aa  253  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  34.16 
 
 		 922 aa  210  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  34.51 
 
 		 883 aa  203  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  35.26 
 
 		 1129 aa  201  7.999999999999999e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  39.93 
 
 		 782 aa  196  2e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  38.76 
 
 		 792 aa  195  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  33.81 
 
 		 963 aa  186  3e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  34.71 
 
 		 984 aa  183  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  29.95 
 
 		 805 aa  173  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  34.21 
 
 		 1097 aa  171  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  27.78 
 
 		 841 aa  108  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  27.68 
 
 		 785 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  27.9 
 
 		 833 aa  102  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  29.6 
 
 		 768 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  28.57 
 
 		 759 aa  98.2  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  27.41 
 
 		 1737 aa  93.6  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  41.35 
 
 		 1390 aa  92.8  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1997  coagulation factor 5/8 type domain protein  55.7 
 
 		 541 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  30.41 
 
 		 565 aa  83.2  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3709  hypothetical protein  39.69 
 
 		 818 aa  83.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.156868 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  25.44 
 
 		 725 aa  82.8  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  27.39 
 
 		 893 aa  78.2  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  22.58 
 
 		 626 aa  74.3  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  25.7 
 
 		 998 aa  72  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  41.18 
 
 		 646 aa  72  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  51.47 
 
 		 731 aa  71.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  22.06 
 
 		 1178 aa  67.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  32.38 
 
 		 147 aa  58.5  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2732  methyltransferase FkbM family  36.73 
 
 		 361 aa  53.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  29.3 
 
 		 468 aa  52.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  30 
 
 		 129 aa  50.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1556  Redoxin domain protein  31.75 
 
 		 677 aa  48.9  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.744848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  31.25 
 
 		 465 aa  48.1  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  29.36 
 
 		 136 aa  47.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  29.91 
 
 		 131 aa  46.6  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  29.6 
 
 		 132 aa  46.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  29.84 
 
 		 507 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  30.09 
 
 		 729 aa  46.2  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  28.83 
 
 		 724 aa  45.8  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>