60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1739 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
805 aa  1663    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  34.82 
 
 
883 aa  421  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  34.74 
 
 
1129 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  32.84 
 
 
792 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  33.29 
 
 
782 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  41.27 
 
 
922 aa  261  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  36.49 
 
 
1097 aa  239  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  32.3 
 
 
984 aa  237  5.0000000000000005e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  29.82 
 
 
1063 aa  218  4e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  34.76 
 
 
917 aa  214  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  31.51 
 
 
963 aa  214  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  35.06 
 
 
1068 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  34.84 
 
 
1013 aa  206  1e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  31.63 
 
 
1066 aa  205  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  32.19 
 
 
922 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  31.75 
 
 
765 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  30.87 
 
 
1074 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  34.2 
 
 
1046 aa  198  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  33.9 
 
 
1182 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  28.23 
 
 
911 aa  193  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  32.2 
 
 
1074 aa  188  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  32.33 
 
 
1091 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  32 
 
 
924 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  30.92 
 
 
776 aa  177  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  29.95 
 
 
1171 aa  174  9e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  29.26 
 
 
772 aa  173  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  28.5 
 
 
1067 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  28.68 
 
 
888 aa  148  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  29.34 
 
 
785 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  28.83 
 
 
768 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  26.92 
 
 
841 aa  127  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  26.26 
 
 
725 aa  110  8.000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  31.2 
 
 
1178 aa  87  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  26.64 
 
 
759 aa  82.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  29.3 
 
 
1737 aa  82  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  40.95 
 
 
724 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  25 
 
 
565 aa  72.4  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  35.25 
 
 
998 aa  70.5  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  23.18 
 
 
833 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  39.33 
 
 
729 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  26.89 
 
 
893 aa  70.1  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  39.39 
 
 
503 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  24.75 
 
 
626 aa  68.9  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2184  Planctomycete cytochrome C  39.78 
 
 
646 aa  68.2  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  34.04 
 
 
465 aa  66.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0299  Planctomycete cytochrome C  28.79 
 
 
147 aa  65.1  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  33.33 
 
 
756 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0638  hypothetical protein  34.55 
 
 
132 aa  55.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134995  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2401  WD-40 repeat protein  35.16 
 
 
651 aa  54.7  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.402251  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  22.94 
 
 
562 aa  52.8  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  30.3 
 
 
468 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0602  hypothetical protein  27.88 
 
 
124 aa  51.6  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0141  hypothetical protein  35.44 
 
 
251 aa  50.8  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  31.58 
 
 
507 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  35.11 
 
 
716 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0336  transmembrane region and signal peptide prediction  27.45 
 
 
129 aa  48.1  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151366  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0465  hypothetical protein  29.13 
 
 
136 aa  47.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3693  hypothetical protein  28.16 
 
 
132 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3227  hypothetical protein  27.18 
 
 
131 aa  46.6  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00220073  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1986  hypothetical protein  33.7 
 
 
299 aa  45.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000747383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>